KdmWiki - Wkład użytkownika [pl]

Szablon:Szkolenia

2011-09-15T14:26:07Z

Igor:

;Nadchodzące
* [http://www.budsoft.com.pl/spotkania Spotkanie Użytkowników Abaqus 2011] - 27-28 października, Poznań
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2011-02|Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS]] - dla grupy minimum 10 słuchaczy
* [http://www.icm.edu.pl/kdm/Computational_materials_engineering_with_MedeA:_Simulation_of_nanoparticle_properties Computational materials engineering with MedeA: Simulation of nanoparticle properties] Szkolenie ICM w Warszawie

;Minione
* [[Szkoła letnia PRACE 2011]] - 29 sierpnia - 1 września 2011, Finlandia
* [[Accelrys - Molecular Modelling/Simulation - Training in Poland]] - od 21 lipca do 4 sierpnia
* [[Szkolenie AIM]] - 12 lipca
* [[Warsztaty - PLATON-U3| Warsztaty - PLATON-U3]] - 28 czerwca 2011, Wrocław
* [[VII Spotkanie Polskich Użytkowników Oprogramowania Accelrys]] - 21-22 czerwca 2011, Warszawa
* [[Warsztaty - ABINIT| Warsztaty - ABINIT]] - semestr letni 2011, Wrocław
* [[Wykłady prof. George’a C. Schatza]] - 6-8 czerwca 2011, PWr
* [[Szkolenie nt. bazy CHEMICAL ABSTRACTS na platformie SciFinder]] - 2 czerwca
* [[Python]] - kurs programowania, 2010/2011
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2011-02|Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS]] - 24 lutego 2011
* [[Warsztaty archiwizacji PLATON | Warsztaty archiwizacji PLATON U4]] - 2 grudnia 2010
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2010-11]] - 22 listopada 2010
* [[Szkolenie SIESTA]] - 28-29 października 2010

[ [[Szkolenia|wszystkie szkolenia]] ]

Szablon:Szkolenia

2011-09-15T14:25:44Z

Igor:

;Nadchodzące
* [http://www.budsoft.com.pl/spotkania Spotkanie Użytkowników Abaqus 2011] - 27-28 października, Poznań
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2011-02|Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS]] - dla grupy minimum 10 słuchaczy\
* [http://www.icm.edu.pl/kdm/Computational_materials_engineering_with_MedeA:_Simulation_of_nanoparticle_properties Computational materials engineering with MedeA: Simulation of nanoparticle properties] Szkolenie ICM w Warszawie

;Minione
* [[Szkoła letnia PRACE 2011]] - 29 sierpnia - 1 września 2011, Finlandia
* [[Accelrys - Molecular Modelling/Simulation - Training in Poland]] - od 21 lipca do 4 sierpnia
* [[Szkolenie AIM]] - 12 lipca
* [[Warsztaty - PLATON-U3| Warsztaty - PLATON-U3]] - 28 czerwca 2011, Wrocław
* [[VII Spotkanie Polskich Użytkowników Oprogramowania Accelrys]] - 21-22 czerwca 2011, Warszawa
* [[Warsztaty - ABINIT| Warsztaty - ABINIT]] - semestr letni 2011, Wrocław
* [[Wykłady prof. George’a C. Schatza]] - 6-8 czerwca 2011, PWr
* [[Szkolenie nt. bazy CHEMICAL ABSTRACTS na platformie SciFinder]] - 2 czerwca
* [[Python]] - kurs programowania, 2010/2011
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2011-02|Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS]] - 24 lutego 2011
* [[Warsztaty archiwizacji PLATON | Warsztaty archiwizacji PLATON U4]] - 2 grudnia 2010
* [[Szkolenie dla początkujących użytkowników WCSS 2010-11]] - 22 listopada 2010
* [[Szkolenie SIESTA]] - 28-29 października 2010

[ [[Szkolenia|wszystkie szkolenia]] ]

Maszyny obliczeniowe

2010-02-05T07:55:55Z

Igor: test edycji

< [[Podręcznik użytkownika KDM]]

Maszyny obliczeniowe [[WCSS]] określane są mianem [[KDM|Komputerów Dużej Mocy]] (KDM). Obsługą tych komputerów zajmuje się [[Zespół Usług Obliczeniowych WCSS]]. Wraz z rozwojem Centrum (założonym w 1995 r.), ewoluuje także sprzęt i zakres usług oferowanych przez dział KDM.

;Serwery
*[[Leo]] (SGI Altix 3700 Bx2)
*[[Tezro]] (SGI Tezro)

;Klastry
*[[Nova]] (klaster x86_64)

;Serwery wycofane z eksploatacji
*[[Alpha]] (Compaq AlphaServer ES40)
*[[Grom]] (SGI Origin 2400)
*[[Gromada]] (klaster Itanium2)
*[[Letycja]] (SGI Onyx)
*[[Panda]] (SGI Octane)
*[[Układ]] (klaster PC)

'''Zobacz też:''' [[Galeria zdjęć KDM]]

{{maszyny obliczeniowe}}

[[Kategoria:Maszyny obliczeniowe]]
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Supernova

2009-10-28T11:58:59Z

Igor: poprawiona liczba węzłów

< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Maszyny obliczeniowe]]
{{serwer|zdjęcie=[[Grafika:Nova2008 15.jpg|thumb|right|200px|Klaster Nova]] |admini=nova @ kdm.wcss.wroc.pl}}
'''Nova''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]], włączony w struktury projektu [[EGEE]]. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 (Intel Core micro Architecture, EM64T).

Elementy klastra:
* węzeł dostępowy (nova),
* dwa węzły usługowe (darkmass/SE i dwarf/CE),
* 328 węzłów obliczeniowych (wn001 - wn328),
* sieć obliczeniowa - [[Infiniband]] DDR fat-tree full-cbb,
* sieć zarządzania - gigabit ethernet.
Zasoby obliczeniowe klastra:
* 2016 rdzeni obliczeniowych,
* ~4 TB pamięci operacyjnej (2GB/rdzeń)
* ~100 TB przestrzeni dyskowej (dyski lokalne + [[Lustre]]),
* komunikacja pomiędzy węzłami klastra: przepływność 20Gbps, opóźnienia < 5 us.

===Zestawienie===
{|
|style="vertical-align: top;" align="right"|
klaster : 
moc obliczeniowa : 
węzły : 
CPU : 
liczba CPU : 
cache : 
pamięć : 
dysk /home : 
dysk /scratch : 
system operacyjny : 
|style="vertical-align: top;"|
'''nova.wcss.wroc.pl''' 
'''19 TFLOPS''' 
'''dostępowy''' 
Intel Xeon 3GHz 
2x dual-core 
4MB 
16GB 
500GB 
- 
ScientificLinux 
|style="vertical-align: top;"|
 
 
'''obliczeniowe (328)''' 
Intel Xeon 2.33/2.4/2.5 GHz 
1 lub 2x quad-core 
4MB 
2GB/core 
- 
160GB/node + [[Lustre]] 
ScientificLinux 
|-
|}

===Oprogramowanie===
;Aplikacje
[[Abaqus]], [[ACES2]], [[Autodock]], [[CAMFR]], [[CPMD]], [[FDS-SMV]] ,[[GAMESS]], [[Gaussian]], [[LAMMPS]], [[Meep]], [[MOLCAS]], [[Molpro]], [[Matlab]], [[NWChem]], [[R]], [[TURBOMOLE]] aplikacje własne użytkowników.

;Kompilatory
[[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]]

;Biblioteki
* [[MVAPICH1]],
* [[MVAPICH2]],
* [[MKL]] (/opt/intel/mkl/WERSJA/lib/em64t/),
* GotoBLAS (/usr/local/lib/),
* ATLAS 3.8.3 (/usr/local/atlas-3.8.3)
* ...

;Narzedzia
* [[MPIEXEC]]

;System kolejkowania
[[PBS]]

===Zalecenia===

* na dysku /home wprowadzone zostały kwoty dyskowe: limit miękki 8GB, limit twardy 10GB, limit czasowy 7 dni; sprawdzenie stanu:
repquota -a
opis systemu kwot:
man quota

* zainstalowane zostały nowe kompilatory Intela oraz nowa biblioteka [[MKL]]; oprogramowanie korzystające ze starych bibliotek może nie uruchamiać się lub pracować nieoptymalnie - wymagana jest rekompilacja;

* oprogramowanie zrównoleglone w standardze MPI musi zostać przekompilowane, aby mogło korzystać z sieci [[Infiniband]]; domyślna implementacja MPI to [[MVAPICH1]];

* zadania MPI uruchamiane poprzez sieć Ethernet a nie [[Infiniband]] bądą zabijane bez ostrzeżenia - sieć Ethernet jest dedykowana dla NFS;

* zadania MPI należy uruchamiac poprzez narzędzie [[MPIEXEC]] a nie mpirun;

* oprogramowanie zrównoleglone w innym standardze niż MPI musi zostać przekonfigurowane - prosimy o kontakt użytkownikow takich aplikacji;

* zalecenia dotyczące współdzielonego dysku scratch - [[Lustre]]

===Zobacz też===
*[[PBS|Jak korzystać z kolejek?]]
*[[Maszyny obliczeniowe]]
*[[Przekierowanie wyświetlania]]
*[[Programy badawcze]]
*[[Galeria zdjęć (Nova)]]
*[http://sun1000.pwr.wroc.pl/PrezentacjaKDM/index.html Galeria zdjęć z uruchomienia]

{{maszyny obliczeniowe}}

[[Kategoria:Maszyny obliczeniowe]]
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]