Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Kompilacja aplikacji równoległych]]</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Kompilacja aplikacji równoległych]]</small> | ||
| − | Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami ([[MPI |mpi]],[[OpenMP | OpenMP]],[[PVM | PVM]]). | + | :Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami ([[MPI |mpi]],[[OpenMP | OpenMP]],[[PVM | PVM]]). |
Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio [[korzystanie z modułów | konfigurując srodowisko systemowe]], do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów. | Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio [[korzystanie z modułów | konfigurując srodowisko systemowe]], do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów. | ||
| − | Na przykład, linkowanie z bibliotekami mvapich2 (jedna z implementacji standardu [[MPI | mpi]]-2) budowanymi intelowskimi kompilatorami można uczynić na dwa sposoby: | + | :Na przykład, linkowanie z bibliotekami mvapich2 (jedna z implementacji standardu [[MPI | mpi]]-2) budowanymi intelowskimi kompilatorami można uczynić na dwa sposoby: |
*'''przy pomocy wrapera na kompilator''' | *'''przy pomocy wrapera na kompilator''' | ||
module load mvapich2/1.5.1p1 | module load mvapich2/1.5.1p1 | ||
Wersja z 12:12, 30 sie 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych
- Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM).
Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.
- Na przykład, linkowanie z bibliotekami mvapich2 (jedna z implementacji standardu mpi-2) budowanymi intelowskimi kompilatorami można uczynić na dwa sposoby:
- przy pomocy wrapera na kompilator
module load mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.5.1p1 echo $PATH /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/ which mpif90 /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/mpif90
- Wraper mpif90 odpowiednio ustawia flagi kopmilatora ifort (standard - fortran90), tak aby aplikacja korzystała z komunikacji międzyprocesowej.
- ręcznie ustawiając odpowiednie flagi
Na klastrze Supernova zainstalowano wiele bibliotek implementujących standardy mpi, mpi-2 oraz OpenMP przy użyciu pakietów kompilatorów opensource`owych (gcc) oraz dostarczonych od intela.
Na przykład.
openmpi/1.4.3 openmpi/1.4.3-intel_10.1 openmpi/1.4.3_gcc412 openmpi/1.4.3_gcc453 mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.6 mvapich2/1.6_gcc