Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 16: | Linia 16: | ||
*'''ręcznie ustawiając odpowiednie flagi''' | *'''ręcznie ustawiając odpowiednie flagi''' | ||
| − | Na klastrze [[SUPERNOVA | | + | Na klastrze [[SUPERNOVA | Nova]] zainstalowano wiele bibliotek implementujących standardy[[MPI | mpi]], [[MPI2 | mpi-2]] oraz [[OpenMP | OpenMP ]] przy użyciu pakietów kompilatorów opensource`owych (gcc) oraz dostarczonych od intela. |
Na przykład. | Na przykład. | ||
Wersja z 12:13, 30 sie 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych
Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM). Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.
Na przykład, linkowanie z bibliotekami mvapich2 (jedna z implementacji standardu mpi-2) budowanymi intelowskimi kompilatorami można uczynić na dwa sposoby:
- przy pomocy wrapera na kompilator
module load mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.5.1p1 echo $PATH /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/ which mpif90 /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/mpif90
- Wraper mpif90 odpowiednio ustawia flagi kopmilatora ifort (standard - fortran90), tak aby aplikacja korzystała z komunikacji międzyprocesowej.
- ręcznie ustawiając odpowiednie flagi
Na klastrze Nova zainstalowano wiele bibliotek implementujących standardy mpi, mpi-2 oraz OpenMP przy użyciu pakietów kompilatorów opensource`owych (gcc) oraz dostarczonych od intela.
Na przykład.
openmpi/1.4.3 openmpi/1.4.3-intel_10.1 openmpi/1.4.3_gcc412 openmpi/1.4.3_gcc453 mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.6 mvapich2/1.6_gcc