Cząsteczka w otoczeniu chemicznym: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 19: | Linia 19: | ||
* W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania do niego dostępu należy zarejestrować się na [http://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?UserID=&AccessCode=&ArchiveID=1190 stronie producenta], zalogować się i przesłać zrzutu ekranu na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl . | * W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania do niego dostępu należy zarejestrować się na [http://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?UserID=&AccessCode=&ArchiveID=1190 stronie producenta], zalogować się i przesłać zrzutu ekranu na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl . | ||
* Wskazana jest znajomość podstawowych pojęć chemii kwantowej, doświadczenie w prowadzeniu prostych obliczeń kwantowo-chemicznych oraz manipulacji plikami w systemie Linux | * Wskazana jest znajomość podstawowych pojęć chemii kwantowej, doświadczenie w prowadzeniu prostych obliczeń kwantowo-chemicznych oraz manipulacji plikami w systemie Linux | ||
| − | * Część warsztatowa odbywać się będzie z wykorzystaniem komputerów WCSS. Wobec tego wymagane jest posiadanie konta obliczeniowego na klastrze Supernova ([http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_zosta%C4%87_u%C5%BCytkownikiem_KDM]) | + | * Część warsztatowa odbywać się będzie z wykorzystaniem komputerów WCSS. Wobec tego wymagane jest posiadanie konta obliczeniowego na klastrze Supernova ([http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Jak_zosta%C4%87_u%C5%BCytkownikiem_KDM Jak zostać użytkownikiem KDM WCSS]) |
Wersja z 09:01, 12 sty 2015
Wrocławskie Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe ma przyjemność zaprosić Państwa do udziału w trzydniowych warsztatach pt. "Cząsteczka w otoczeniu chemicznym"
- Termin: 25-27 lutego 2015 godz. 10:00-16:00
- Miejsce: sala 201, bud. D-21 PWr, Wrocław (Położenie WCSS)
- Prowadzący: Prof. Wojciech Bartkowiak, Dr hab. Robert Góra, Dr Paweł Lipkowski
Tematyka
W ramach warsztatów zaprezentowane zostaną metody teoretyczne stosowane w badaniach właściwości fizykochemicznych molekuł w fazach skondensowanych.
W szczególności, szkolenie dotyczyć będzie następujących zagadnień:
- modele rozpuszczalnika stosowane w obliczeniach kwantowo-chemicznych (ze szczególnym uwzględnieniem ciągłych modeli rozpuszczalnika);
- procedura wyznaczania energii oddziaływania międzymolekularnego kompleksów molekularnych znajdujących się w fazach skondensowanych;
- metody teoretyczne stosowane w opisie właściwości układów ograniczonych przestrzennie (kompleksy endohedralne, materia w warunkach wysokiego ciśnienia)
- kwantowa teoria atomów w cząsteczkach - podstawy teoretyczne i aplikacyjne na przykładzie kompleksów z wiązaniem wodorowym
Wymagania
- Do pełnego uczestnictwa w warsztatach niezbędne będą własne laptopy pozwalające na dostęp do sieci bezprzewodowej (która będzie zapewniona przez WCSS).
- Należy samodzielnie zainstalować program do łączenia / transferu danych (dla Linuksa typowe komendy ssh, sftp; dla Windows - np. putty jako klient SSH, winscp jako klient SFTP) i przetestować łączenie z własnym kontem na klastrze Supernova.
- W trakcie warsztatów wykorzystywany będzie program VMD. W celu uzyskania do niego dostępu należy zarejestrować się na stronie producenta, zalogować się i przesłać zrzutu ekranu na adres: justyna.kozlowska at pwr.edu.pl .
- Wskazana jest znajomość podstawowych pojęć chemii kwantowej, doświadczenie w prowadzeniu prostych obliczeń kwantowo-chemicznych oraz manipulacji plikami w systemie Linux
- Część warsztatowa odbywać się będzie z wykorzystaniem komputerów WCSS. Wobec tego wymagane jest posiadanie konta obliczeniowego na klastrze Supernova (Jak zostać użytkownikiem KDM WCSS)