Korzystanie z modułów: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
Teresa Sas (dyskusja | edycje) |
|||
| (Nie pokazano 12 wersji utworzonych przez 4 użytkowników) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < Korzystanie z modułów</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < Korzystanie z modułów</small> | ||
| − | === Moduły === | + | === Moduły - wersja domyślna=== |
'''Moduł''' - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie '''nazwa_aplikacji/wersja''', np.'''gaussian/g09.E.01 '''. Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne '''PATH''' oraz '''LD_LIBRARY_PATH''', lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze. | '''Moduł''' - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie '''nazwa_aplikacji/wersja''', np.'''gaussian/g09.E.01 '''. Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne '''PATH''' oraz '''LD_LIBRARY_PATH''', lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze. | ||
| − | {{uwaga2|Z mechanizmu należy korzystać na węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych).}} | + | {{uwaga2|Z mechanizmu należy korzystać na ui.wcss.pl lub węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych).}} |
'''Polecenie''': | '''Polecenie''': | ||
*'''module avail''' - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania | *'''module avail''' - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania | ||
| − | + | # wylistuj wszystkie dostępne moduly | |
| − | + | module avail | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | + | # wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona: | |
| − | + | module avail Python | |
| − | + | ||
| − | + | # wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona ignorując rozmiar znaków: | |
| − | + | module avail -i python | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
* '''module load [nazwa_modułu]''' - ładuje moduł [nazwa_modułu] | * '''module load [nazwa_modułu]''' - ładuje moduł [nazwa_modułu] | ||
| + | |||
$ module load intel/12.1 | $ module load intel/12.1 | ||
| − | + | binutils/2.25 load complete. | |
| − | + | intel/12.1 load complete. | |
| + | |||
| + | Loading intel/12.1 | ||
| + | Loading requirement: binutils/2.25 | ||
| + | |||
* '''module list''' - wyświetla załadowane moduły | * '''module list''' - wyświetla załadowane moduły | ||
$ module list | $ module list | ||
Currently Loaded Modulefiles: | Currently Loaded Modulefiles: | ||
| − | 1) binutils/2.25 | + | 1) binutils/2.25 2) intel/12.1 |
| + | |||
| + | Key: | ||
| + | auto-loaded default-version | ||
| + | |||
| + | Key oznacza klucz wg którego rozróżniane są moduły, w powyższym przykładzie moduł binutils jest oznaczony jako moduł "auto-loaded" czyli załadowany jako zależność a moduł intel jest jako "default-version" czyli ten o który docelowo nam chodziło wykonując polecenie `modue load`. | ||
| + | |||
* '''module rm [nazwa_modułu]''' - usuwa załadowany moduł | * '''module rm [nazwa_modułu]''' - usuwa załadowany moduł | ||
$ module rm binutils | $ module rm binutils | ||
| Linia 379: | Linia 43: | ||
1) intel/12.1 | 1) intel/12.1 | ||
* '''module purge''' - usuwa wszystkie moduły | * '''module purge''' - usuwa wszystkie moduły | ||
| + | |||
| + | === Nowe moduły [4.7] === | ||
| + | |||
| + | Nowe moduły zostały wprowadzone jako domyślne w dniu 04.05.2021. | ||
| + | |||
| + | ==== Co zmieniają nowe moduły ==== | ||
| + | Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele. | ||
| + | Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to: | ||
| + | * dużo szybsze działanie programu | ||
| + | * jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less) | ||
| + | * nowy bardziej szczegółowy help | ||
| + | * program jest bardziej ''gadatliwy'' informuje np. jakie zależności załadował z głównym modułem | ||
| + | * domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`) | ||
| + | * module list pokazuje załadowane zależności w z tłem a moduł docelowy bez | ||
| + | * pokolorowany output | ||
| + | Listę zmian można zobaczyć na stronie: | ||
| + | https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html | ||
| + | lub tu: https://github.com/cea-hpc/modules/releases/ | ||
| + | ==== Nowe argumenty polecenia module ==== | ||
| + | {{uwaga2|Zostaną dopisane. Polecamy wykonać `module --help`}} | ||
| + | ==== Zaobserowane wady/zalety nowych modułów ==== | ||
| + | Brak zgłoszonych uwag. | ||
| + | |||
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | [[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | ||
Aktualna wersja na dzień 11:12, 4 maj 2021
< Podręcznik użytkownika KDM < Korzystanie z modułów
Moduły - wersja domyślna
Moduł - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie nazwa_aplikacji/wersja, np.gaussian/g09.E.01 . Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne PATH oraz LD_LIBRARY_PATH, lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze.
| ! | Z mechanizmu należy korzystać na ui.wcss.pl lub węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych). |
Polecenie:
- module avail - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania
# wylistuj wszystkie dostępne moduly module avail
# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona: module avail Python
# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona ignorując rozmiar znaków: module avail -i python
- module load [nazwa_modułu] - ładuje moduł [nazwa_modułu]
$ module load intel/12.1 binutils/2.25 load complete. intel/12.1 load complete. Loading intel/12.1 Loading requirement: binutils/2.25
- module list - wyświetla załadowane moduły
$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) binutils/2.25 2) intel/12.1 Key: auto-loaded default-version
Key oznacza klucz wg którego rozróżniane są moduły, w powyższym przykładzie moduł binutils jest oznaczony jako moduł "auto-loaded" czyli załadowany jako zależność a moduł intel jest jako "default-version" czyli ten o który docelowo nam chodziło wykonując polecenie `modue load`.
- module rm [nazwa_modułu] - usuwa załadowany moduł
$ module rm binutils binutils/2.25 unload complete $ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/12.1
- module purge - usuwa wszystkie moduły
Nowe moduły [4.7]
Nowe moduły zostały wprowadzone jako domyślne w dniu 04.05.2021.
Co zmieniają nowe moduły
Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele. Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to:
- dużo szybsze działanie programu
- jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
- nowy bardziej szczegółowy help
- program jest bardziej gadatliwy informuje np. jakie zależności załadował z głównym modułem
- domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
- module list pokazuje załadowane zależności w z tłem a moduł docelowy bez
- pokolorowany output
Listę zmian można zobaczyć na stronie: https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html lub tu: https://github.com/cea-hpc/modules/releases/
Nowe argumenty polecenia module
| ! | Zostaną dopisane. Polecamy wykonać `module --help` |
Zaobserowane wady/zalety nowych modułów
Brak zgłoszonych uwag.