Warsztaty - ABINIT: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 25 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika)
Linia 2: Linia 2:
  
 
*'''Termin: wtorek, 17.05-18.55''' semestr letni 2011
 
*'''Termin: wtorek, 17.05-18.55''' semestr letni 2011
−
*'''Miejsce: Instytut Fizyki PWR, budynek A-1, salka 504B'''  
+
*'''Miejsce: Instytut Fizyki PWR, budynek A-1, sala 320A'''  
 
*'''Temat:''' wybrane możliwości obliczeniowe pakietu ABINIT; podstawy teoretyczne; zajęcia praktyczne.  
 
*'''Temat:''' wybrane możliwości obliczeniowe pakietu ABINIT; podstawy teoretyczne; zajęcia praktyczne.  
 
*'''Prowadzący:''' dr inż. Paweł Scharoch, Instytut Fizyki PWR   
 
*'''Prowadzący:''' dr inż. Paweł Scharoch, Instytut Fizyki PWR   
−
* '''Materiały:''' http://www.abinit.org/
+
* '''Materiały:''' http://www.abinit.org/, http://www.if.pwr.wroc.pl/~scharoch/Abinitio/Warsztaty.html
  
 
==Zgłoszenia==
 
==Zgłoszenia==
Linia 13: Linia 13:
  
 
==Wymagania ==
 
==Wymagania ==
−
Znajomość podstaw mechaniki kwantowej. Przydatny byłby laptop z systemem LINUX.  
+
Znajomość podstaw mechaniki kwantowej. Znajomość podstawowych komend systemu LINUX. Przydatny laptop z systemem LINUX.  
  
 
==Plan zajęć==
 
==Plan zajęć==
Linia 20: Linia 20:
 
(klatka schodowa po prawej stronie patrząc od wejścia głównego, na drugim piętrze).  
 
(klatka schodowa po prawej stronie patrząc od wejścia głównego, na drugim piętrze).  
  
−
  Na pierwszym spotkaniu:  
+
  Spotkanie pierwsze:  
  
−
1. Wprowadzenie od obliczeń z zasad pierwszych, opartych na teorii funkcjonału gęstości.
+
1.Przegląd strony www projektu ABINIT
  
 
2.O projekcie ABINIT
 
2.O projekcie ABINIT
Linia 28: Linia 28:
 
3.Wprowadzenie do programu ABINIT
 
3.Wprowadzenie do programu ABINIT
  
−
- możliwości obliczeniowe
+
4.Dyskusja na temat formuły warsztatów (propozycje prezentacji)
−
- instalacja
 
−
- struktura pliku wejściowego
 
−
- podstawowe parametry obliczeniowe
 
−
- pliki wyjściowe
 
−
- tutorial1: 4 podstawowe lekcje
 
−
- tutorial2: lekcje zaawansowane
 
−
- testy automatyczne
 
  
−
3.Dyskusja na temat formuły warsztatów (propozycje prezentacji)
+
5.Wprowadzenie od obliczeń z zasad pierwszych opartych na teorii funkcjonału gęstości, przyblizenia funkcjonałów korelacji-wymiany
  
−
4.Wizyta w pracowni komputerowej
+
6.Reprezentacja równań Kohan-Shama w bazie fal płaskich.
  
 +
Spotkanie drugie:
 +
 +
1. Omówienie struktury plików wejściowych
 +
 +
2. Podstawowe parametry obliczeniowe
 +
 +
3. Przegląd głównego pliku wyjściowego *.out
 +
 +
4. Lekcja 1: cząsteczka H2 w superkomórce, bez analizy zbieżności (pierwsze uruchomienie programu, obliczenia energii całkowitej, wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą skanowania energii). 
 +
 +
Spotkanie trzecie i czwarte:
 +
 +
1. Lekcja 1 (kontynuacja) (wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą relaksacji, wyznaczanie energii atomizacji)
 +
 +
2. Wykorzystanie programów AWK i GREP do analizy plików wyjściowych 
 +
 +
3. Lekcja 2, cząsteczka H2 z analizą zbieżności (zbieżność ze względu na energię odcięcia i parametr sieci, obliczenia końcowe z wykorzystaniem funkcjonałów LDA i GGA)
 +
 +
4. Program pomocniczy cut3D 
 +
 +
5. Wizualizacje z wykorzystaniem programu GNUPLOT (zbieżność energii, gęstość elektronowa, potencjał).   
 +
 +
Spotkanie piąte:
 +
 +
1. Wprowadzenie do teorii funkcjonału gęstości.
 +
 +
2. Pseudopotencjały zachowujace normę. 
 +
 +
Spotkanie szóste:
 +
 +
1. Pseudopotencjały zachowujące normę: konstruowanie  – od  postaci nielokalnej do
 +
w pełni rozseparowanej
 +
 +
2. Lekcja 3 – kryształ krzemu;  znaczenie specjalnych punktów k (testowanie zbieżności),
 +
wyznaczanie parametrów sieci,  wyznaczanie struktury pasmowej Kohna-Shama
 +
(obliczenia niesamouzgodnione)
 +
 +
  Spotkanie siódme i ósme:
 +
 +
1. Kryształ i powierzchnia aluminium; znaczenie parametru 'tsmear', rozkład gęstości ładunku w metalu
 +
 +
2. Modelowanie powierzchni i układów adsorbatów; wyznaczanie energii powierzchniowej (zbieżność ze
 +
względu na grubość warstwy atomów i warstwy próżni)
 +
 +
  Spotkanie dziewiąte:
 +
 +
1. Odpowiedź układu na zaburzenie zewnętrzne: odchylenie atomu z polożenia równowagi, odkształecenie
 +
kryształu, pole elektryczne, zaburzenia mieszane; metody "bezpośrednie" i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału
 +
gestości (DFPT)
 +
 +
2. Dynamika/termodynamika sieci w przybliżeniu harmonicznym - wprowadzenie.
 +
 +
  Spotkanie dziesiąte:
 +
 +
1. Lekcja - funkcja odpowiedzi 1;  podstawy wyznaczania funkcji liniowej dpowiedzi: dynamiczne i dielektryczne
 +
własności AlAs (fonony, tensor dielektryczny, ładunek efektywny Borna) 
 +
 +
2. Lekcja - analiza bazy danych pochodnych (DDB - 'Derivative Data Base')
 +
 
 +
 +
 +
----------------------------------------------------------------------------------------
 +
'''Proszę o zgłaszanie tematów szczegółowych (do omówienia i przećwiczenia w ramach warsztatów)'''
 
----------------------------------------------------------------------------------------
 
----------------------------------------------------------------------------------------
  
−
Wstępna propozycja tematyki warsztatów  (prezentacje teoretyczne i zajęcia praktyczne):  
+
Wstępne propozycje tematów szczegółowych (prezentacje teoretyczne i zajęcia praktyczne):  
  
 
1.Elementy teorii funkcjonału gęstości
 
1.Elementy teorii funkcjonału gęstości

Aktualna wersja na dzień 09:55, 9 maj 2011

WCSS zaprasza na warsztaty z programu ABINIT.

Zgłoszenia

Udział w warsztatach jest bezpłatny dla użytkowników KDM WCSS.

Zgłoszenia, zawierające imię i nazwisko oraz nazwę miejsca pracy zgłaszanej osoby można kierować do prowadzącego (pawel.scharoch@pwr.wroc.pl). W temacie listu należy umieścić słowa: "Warsztaty ABINIT".

Wymagania

Znajomość podstaw mechaniki kwantowej. Znajomość podstawowych komend systemu LINUX. Przydatny laptop z systemem LINUX.

Plan zajęć

Pierwsze spotkanie w dniu 22.03.2011r., sala 321, budynek A-1 (PWR, Wyb. Wyspiańskiego 27) (klatka schodowa po prawej stronie patrząc od wejścia głównego, na drugim piętrze). 

Spotkanie pierwsze:

1.Przegląd strony www projektu ABINIT

2.O projekcie ABINIT

3.Wprowadzenie do programu ABINIT

4.Dyskusja na temat formuły warsztatów (propozycje prezentacji)

5.Wprowadzenie od obliczeń z zasad pierwszych opartych na teorii funkcjonału gęstości, przyblizenia funkcjonałów korelacji-wymiany

6.Reprezentacja równań Kohan-Shama w bazie fal płaskich. 

Spotkanie drugie:

1. Omówienie struktury plików wejściowych

2. Podstawowe parametry obliczeniowe

3. Przegląd głównego pliku wyjściowego *.out

4. Lekcja 1: cząsteczka H2 w superkomórce, bez analizy zbieżności (pierwsze uruchomienie programu, obliczenia energii całkowitej, wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą skanowania energii). 

Spotkanie trzecie i czwarte:

1. Lekcja 1 (kontynuacja) (wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą relaksacji, wyznaczanie energii atomizacji)

2. Wykorzystanie programów AWK i GREP do analizy plików wyjściowych

3. Lekcja 2, cząsteczka H2 z analizą zbieżności (zbieżność ze względu na energię odcięcia i parametr sieci, obliczenia końcowe z wykorzystaniem funkcjonałów LDA i GGA)

4. Program pomocniczy cut3D

5. Wizualizacje z wykorzystaniem programu GNUPLOT (zbieżność energii, gęstość elektronowa, potencjał). 

Spotkanie piąte:

1. Wprowadzenie do teorii funkcjonału gęstości.

2. Pseudopotencjały zachowujace normę. 

Spotkanie szóste:

1. Pseudopotencjały zachowujące normę: konstruowanie – od postaci nielokalnej do w pełni rozseparowanej

2. Lekcja 3 – kryształ krzemu; znaczenie specjalnych punktów k (testowanie zbieżności), wyznaczanie parametrów sieci, wyznaczanie struktury pasmowej Kohna-Shama (obliczenia niesamouzgodnione) 

 Spotkanie siódme i ósme:

1. Kryształ i powierzchnia aluminium; znaczenie parametru 'tsmear', rozkład gęstości ładunku w metalu

2. Modelowanie powierzchni i układów adsorbatów; wyznaczanie energii powierzchniowej (zbieżność ze względu na grubość warstwy atomów i warstwy próżni) 

 Spotkanie dziewiąte:

1. Odpowiedź układu na zaburzenie zewnętrzne: odchylenie atomu z polożenia równowagi, odkształecenie kryształu, pole elektryczne, zaburzenia mieszane; metody "bezpośrednie" i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału gestości (DFPT)

2. Dynamika/termodynamika sieci w przybliżeniu harmonicznym - wprowadzenie. 

 Spotkanie dziesiąte:

1. Lekcja - funkcja odpowiedzi 1; podstawy wyznaczania funkcji liniowej dpowiedzi: dynamiczne i dielektryczne własności AlAs (fonony, tensor dielektryczny, ładunek efektywny Borna)

2. Lekcja - analiza bazy danych pochodnych (DDB - 'Derivative Data Base')


Proszę o zgłaszanie tematów szczegółowych (do omówienia i przećwiczenia w ramach warsztatów)

Wstępne propozycje tematów szczegółowych (prezentacje teoretyczne i zajęcia praktyczne):

1.Elementy teorii funkcjonału gęstości

2.Stan podstawowy układu (cząsteczka, kryształ, powierzchnia+adsorbaty, warstwy wolno stojące, druty) - struktura geometryczna i elektronowa - wizualizacja geometrii i gęstości elektronowej - energetyczna gęstość stanów, rzutowana gęstość stanów

3.Odpowiedź układu na zaburzenia zewnętrzne - przemieszczenia atomów - odkształcenia makroskopowe - pole elektryczne - zaburzenia mieszane. Metody bezpośrednie i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału gęstości (DFPT); odpowiedź liniowa i nieliniowa.

4.Dynamika/termodynamika układów - przybliżenie harmoniczne - dynamika molekularna

5.Stany wzbudzone - metoda Δ(SCF) - teoria funkcjonału gęstości zależnego od czasu (tylko układy zlokalizowane) -GW

6.Reprezentacje atomów - pseudopotencjały zachowujące normę - PAWy

7.Magnetyzm kolinearny i niekolinearny

Źródło: „https://kdm.wcss.pl/w/index.php?title=Warsztaty_-_ABINIT&oldid=1582”