Kompilacja aplikacji na klastrze: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
m |
|||
| (Nie pokazano 10 wersji utworzonych przez 5 użytkowników) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < Kompilacja aplikacji na klastrze</small> |
| − | Użytkownik może kompilować swoje oprogramowanie zgodnie z regułami pracy na klastrze. Niedopuszczalna jest kompilacja na węźle dostępowym ( | + | Użytkownik może kompilować swoje oprogramowanie zgodnie z regułami pracy na klastrze. Niedopuszczalna jest kompilacja na węźle dostępowym (bem.wcss.pl). |
Kompilację programu należy traktować jako jedno z zadań i wstawiać do jednej z kolejek systemu [[PBS]]. Najprościej jest zgłosić żądanie o dostęp do zasobów w trybie interaktywnym, wówczas system kolejkowy przydziela powłokę (''shell'') umożliwiając interaktywną pracę na węzłach obliczeniowych. | Kompilację programu należy traktować jako jedno z zadań i wstawiać do jednej z kolejek systemu [[PBS]]. Najprościej jest zgłosić żądanie o dostęp do zasobów w trybie interaktywnym, wówczas system kolejkowy przydziela powłokę (''shell'') umożliwiając interaktywną pracę na węzłach obliczeniowych. | ||
W tym celu należy wykonać polecenie (kolejki i wymagania są przykładowe): | W tym celu należy wykonać polecenie (kolejki i wymagania są przykładowe): | ||
| − | * zadanie interaktywne | + | * zadanie interaktywne, z limitem <code>walltime</code> 6 godzin , z zasobami - <code>1 rdzeń i 1 GB pamięci RAM</code>: |
| − | '''qsub -I -l | + | '''qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=icc -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb''' |
| − | |||
| − | |||
'''Uwaga:''' Zadania kompilacji powinny być oznaczone parametrem <code>-l software=nazwa_kompilatora</code>. | '''Uwaga:''' Zadania kompilacji powinny być oznaczone parametrem <code>-l software=nazwa_kompilatora</code>. | ||
| + | |||
| + | '''Przykład zastosowania:''' | ||
| + | '''$ qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=gcc -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb''' | ||
| + | '''$ module load gcc/5.2.0''' | ||
| + | ''' binutils/2.25 load complete.''' | ||
| + | ''' gcc/5.2.0 load complete.''' | ||
| + | '''$ gcc hello_world.c -o hello_world''' | ||
Po przyznaniu zasobów i otrzymaniu powłoki należy przygotować swoje środowisko pracy do kompilacji korzystając z [[Korzystanie z modułów | modułów]]. | Po przyznaniu zasobów i otrzymaniu powłoki należy przygotować swoje środowisko pracy do kompilacji korzystając z [[Korzystanie z modułów | modułów]]. | ||
| Linia 18: | Linia 23: | ||
* [[Kompilacja aplikacji równoległych]] | * [[Kompilacja aplikacji równoległych]] | ||
* [[Linkowanie z bibliotekami numerycznymi]] | * [[Linkowanie z bibliotekami numerycznymi]] | ||
| + | * [[Korzystanie z modułów]] | ||
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | [[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | ||
Aktualna wersja na dzień 08:00, 2 wrz 2016
< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji na klastrze
Użytkownik może kompilować swoje oprogramowanie zgodnie z regułami pracy na klastrze. Niedopuszczalna jest kompilacja na węźle dostępowym (bem.wcss.pl).
Kompilację programu należy traktować jako jedno z zadań i wstawiać do jednej z kolejek systemu PBS. Najprościej jest zgłosić żądanie o dostęp do zasobów w trybie interaktywnym, wówczas system kolejkowy przydziela powłokę (shell) umożliwiając interaktywną pracę na węzłach obliczeniowych.
W tym celu należy wykonać polecenie (kolejki i wymagania są przykładowe):
- zadanie interaktywne, z limitem
walltime6 godzin , z zasobami -1 rdzeń i 1 GB pamięci RAM:
qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=icc -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
Uwaga: Zadania kompilacji powinny być oznaczone parametrem -l software=nazwa_kompilatora.
Przykład zastosowania:
$ qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=gcc -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb $ module load gcc/5.2.0 binutils/2.25 load complete. gcc/5.2.0 load complete. $ gcc hello_world.c -o hello_world
Po przyznaniu zasobów i otrzymaniu powłoki należy przygotować swoje środowisko pracy do kompilacji korzystając z modułów.
Zobacz też: