CASTEP: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
m (1 wersja) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]]</small> | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]] < [[Materials Studio]]</small> |
| − | + | {{zasobytab|logo=|serwery=[[Leo]]}} | |
'''CASTEP''' jest dostępny na [[Leo]] w ramach pakietu [[Materials Studio]] 4.0 i licencji krajowej POLAND COUNTRYWIDE LICENSE. | '''CASTEP''' jest dostępny na [[Leo]] w ramach pakietu [[Materials Studio]] 4.0 i licencji krajowej POLAND COUNTRYWIDE LICENSE. | ||
| Linia 29: | Linia 29: | ||
Zadania z pakietu Accelrys nalezy wstawiac na [[Leo]] do kolejki accelrys | Zadania z pakietu Accelrys nalezy wstawiac na [[Leo]] do kolejki accelrys | ||
| − | ==Literatura== | + | == Literatura == |
*[http://www.atypon-link.com/OLD/doi/abs/10.1524/zkri.220.5.567.65075 First principles methods using CASTEP] | *[http://www.atypon-link.com/OLD/doi/abs/10.1524/zkri.220.5.567.65075 First principles methods using CASTEP] | ||
[[Kategoria:Oprogramowanie]] | [[Kategoria:Oprogramowanie]] | ||
Wersja z 09:41, 9 lut 2010
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie naukowe < Accelrys < Materials Studio
|
CASTEP jest dostępny na Leo w ramach pakietu Materials Studio 4.0 i licencji krajowej POLAND COUNTRYWIDE LICENSE.
Przykladowe uruchomienie zadania wsadowego w programie CASTEP. Skrypt zostal wygenerowany automatycznie przy użyciu klienta windows. Pliki z danymi zostały umieszczone w katalogu /scratch/$USER/zadanie1 .
#!/bin/sh -f
if [ -f /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/license/data/lic_setup.sh ]; then
eval `/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/license/data/lic_setup.sh \
/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/ -s sh`
fi
if [ -f /usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/bin/ms_setup.sh ]; then
eval `/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/share/bin/ms_setup.sh \
/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/ -s sh`
fi
JOB_SCRATCH=/scratch/$USER/zadanie1
PBS_TMPDIR="$TMPDIR"
TMPDIR="$JOB_SCRATCH/tmp"
export PBS_TMPDIR TMPDIR
cd $JOB_SCRATCH
mkdir -p $TMPDIR
/usr/local/Accelrys/MaterialsStudio4.0/CASTEP/bin/castepexe.exe zadanie1 2> std_err.txt
Skrypt nalezy zapisac w pliku (np. skrypt.sh) i wstawić do kolejki poleceniem
qsub -V -N ''nazwa_zadania'' -q ''nazwa_kolejki'' skrypt.sh
Pliki wejsciowe, czyli zadanie1.cell oraz zadanie1.param nalezy umiescic w katalogu /scratch/$USER/zadanie1 Zadania z pakietu Accelrys nalezy wstawiac na Leo do kolejki accelrys