Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami
Linia 19: | Linia 19: | ||
Na przykład. | Na przykład. | ||
− | + | * openmpi/1.4.3 | |
− | + | * openmpi/1.4.3-intel_10.1 | |
− | + | * openmpi/1.4.3_gcc412 | |
− | + | * openmpi/1.4.3_gcc453 | |
− | + | * mvapich2/1.5.1p1 | |
− | + | * mvapich2/1.6 | |
− | + | * mvapich2/1.6_gcc | |
Odpowiednie ustawieu środowiska pracy polaga na : | Odpowiednie ustawieu środowiska pracy polaga na : |
Wersja z 12:24, 30 sie 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych
Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM). Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.
Na przykład, linkowanie z bibliotekami mvapich2 (jedna z implementacji standardu mpi-2) budowanymi intelowskimi kompilatorami można uczynić na dwa sposoby:
- przy pomocy wrapera na kompilator
module load mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.5.1p1 echo $PATH /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/ which mpif90 /usr/local/mpi/intel/mvapich2-1.5.1p1-intel_composerxe-2011.1.107/bin/mpif90
- Wraper mpif90 odpowiednio ustawia flagi kopmilatora ifort (standard - fortran90), tak aby aplikacja korzystała z komunikacji międzyprocesowej.
- ręcznie ustawiając odpowiednie flagi
Na klastrze Supernova zainstalowano wiele bibliotek implementujących standardy mpi, mpi-2 oraz OpenMP przy użyciu pakietów kompilatorów opensource`owych (gcc) oraz dostarczonych od intela.
Na przykład.
- openmpi/1.4.3
- openmpi/1.4.3-intel_10.1
- openmpi/1.4.3_gcc412
- openmpi/1.4.3_gcc453
- mvapich2/1.5.1p1
- mvapich2/1.6
- mvapich2/1.6_gcc
Odpowiednie ustawieu środowiska pracy polaga na :
- załadowaniu moduły dla wybranego kompilatora np.
module load intel/12.0 intel/12.0 load complete