GPGPU: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(Utworzono nową stronę " == Korzystanie z akceleratorów GPGPU w WCSS == Klaster Bem jest wyposażony w węzły obliczeniowe z akceleratorami GPGPU. Konfiguracja każdego węzła: * dwa p...") |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
== Korzystanie z akceleratorów GPGPU w WCSS == | == Korzystanie z akceleratorów GPGPU w WCSS == | ||
| + | |||
Klaster [[Bem]] jest wyposażony w węzły obliczeniowe z akceleratorami GPGPU. | Klaster [[Bem]] jest wyposażony w węzły obliczeniowe z akceleratorami GPGPU. | ||
| + | |||
Konfiguracja każdego węzła: | Konfiguracja każdego węzła: | ||
| Linia 12: | Linia 14: | ||
=== Zlecanie zadań === | === Zlecanie zadań === | ||
| + | |||
Zadania należy zlecać do kolejki "gpu". Dostęp do kolejki zostaje przyznany po złożeniu wniosku w systemie [[Kontakt|pomocy]]. Wnioski są analizowane indywidualnie. | Zadania należy zlecać do kolejki "gpu". Dostęp do kolejki zostaje przyznany po złożeniu wniosku w systemie [[Kontakt|pomocy]]. Wnioski są analizowane indywidualnie. | ||
Wersja z 15:17, 25 sty 2018
Korzystanie z akceleratorów GPGPU w WCSS
Klaster Bem jest wyposażony w węzły obliczeniowe z akceleratorami GPGPU.
Konfiguracja każdego węzła:
- dwa procesory Intel Xeon, architektura Skylake, łącznie 24 rdzenie, taktowanie nominalne 2,60 GHz,
- 128 GB pamięci operacyjnej,
- interfejs InfiniBand FDR 56Gbps,
- jedna lub dwie karty NVIDIA Tesla P100,
- na każdym węźle dostępne są te same systemy plików co na wszystkich pozostałych węzłach klastra Bem.
Zlecanie zadań
Zadania należy zlecać do kolejki "gpu". Dostęp do kolejki zostaje przyznany po złożeniu wniosku w systemie pomocy. Wnioski są analizowane indywidualnie.
Zlecanie zadań wsadowych:
qsub -q gpu -l select=G:mpiprocs=N:ncpus=N:mem=Mgb:ngpus=1 -l walltime=H:0:0 skrypt-zadania.sh
Zlecanie zadań interaktywnych:
qsub -q gpu -l select=G:mpiprocs=N:ncpus=N:mem=Mgb:ngpus=1 -l walltime=H:0:0 -I
gdzie:
- G - liczba kart GPU,
- N - liczba rdzeni w każdym chunku, jeśli G jest większe niż 1, to N nie może być większe niż 8,
- M - wielkość pamięci w GB w każdym chunku, jeśli G jest większe niż 1, to M nie może być większe niż 8000 MB,
- w każdym przypadku należy ustawiać wartość ngpus=1. W przeciwnym razie zadanie nigdy nie wystartuje,
- H - czas zadania w godzinach, maksymalnie 168 (7 dni).