Korzystanie z modułów: Różnice pomiędzy wersjami

Wersja z 06:44, 9 mar 2021

< Podręcznik użytkownika KDM < Korzystanie z modułów

Moduły - wersja domyślna

Moduł - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie nazwa_aplikacji/wersja, np.gaussian/g09.E.01 . Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne PATH oraz LD_LIBRARY_PATH, lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze.

!	Z mechanizmu należy korzystać na ui.wcss.pl lub węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych).

Polecenie:

module avail - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania

# wylistuj wszystkie dostępne moduly
module avail

# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona:
module avail Python

module load [nazwa_modułu] - ładuje moduł [nazwa_modułu]

$ module load intel/12.1
 binutils/2.25 load complete.
 intel/12.1 load complete.

module list - wyświetla załadowane moduły

$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
 1) binutils/2.25(default)   2) intel/12.1

module rm [nazwa_modułu] - usuwa załadowany moduł

$ module rm binutils
binutils/2.25 unload complete
$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
 1) intel/12.1

module purge - usuwa wszystkie moduły

Nowe moduły [4.7] - wersja testowa

Co zmieniają nowe moduły

Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele. Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to:

dużo szybsze działanie programu
jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
nowy bardziej szczegółowy help
program jest bardziej gadatliwy informuje np. jakie zależności załadował z głównym modułem
domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
module list pokazuje załadowane zależności w z tłem a moduł docelowy bez
pokolorowany output

Listę zmian można zobaczyć na stronie: https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html

Nowe argumenty polecenia module

Zaobserowane wady/zalety nowych modułów

Jak testować?

Jednorazowo

Wystarczy wykonać następujące polecenie:

. /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/profile.sh

Na stałe

Dodajemy na końcu swojego ~/.bashrc:

# use modules v4.7.0
source /usr/local/environmentmodules/4.7.0/init/bash

@@ Linia 1: / Linia 1: @@
 <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < Korzystanie z modułów</small>
-=== Moduły ===
+=== Moduły - wersja domyślna===
 '''Moduł''' - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie '''nazwa_aplikacji/wersja''', np.'''gaussian/g09.E.01 '''. Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne '''PATH''' oraz '''LD_LIBRARY_PATH''', lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze.
@@ Linia 30: / Linia 30: @@
 * '''module purge''' - usuwa wszystkie moduły
-=== Nowe moduły [4.7] TESTY ===
+=== Nowe moduły [4.7] - wersja testowa ===
 ==== Co zmieniają nowe moduły ====
 Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele.
@@ Linia 37: / Linia 37: @@
 * jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
 * nowy bardziej szczegółowy help
+* program jest bardziej ''gadatliwy'' informuje np. jakie zależności załadował z głównym modułem
 * domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
+* module list pokazuje załadowane zależności w z tłem a moduł docelowy bez
 * pokolorowany output
 Listę zmian można zobaczyć na stronie: