AutoDock: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | ||
| − | {{ | + | {{aplikacja|nazwa=AutoDock|logo=|serwer=[[Nova]]|wersja=4.2.3 }} |
'''AutoDock''' - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej. | '''AutoDock''' - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej. | ||
| Linia 17: | Linia 17: | ||
> sub-autogrid test.gpf normal | > sub-autogrid test.gpf normal | ||
> sub-autodock test.dpf normal | > sub-autodock test.dpf normal | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
== Dokumentacja == | == Dokumentacja == | ||
Wersja z 09:46, 18 lip 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
| AutoDock | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Nova | 4.2.3 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
AutoDock - aplikacja służąca do przewidywania sposobu wiązania się ligandów do receptora o znanej strukturze przestrzennej.
Opis funkcjonalności znajduje się na stronie domowej projektu: AutoDock.
Korzystanie z AutoDocka w WCSS
AutoDock jest aplikacją sekwencyjną.
Obliczenia uruchamia się poleceniem:
> sub-autogrid <plik.gpf> [kolejka] > sub-autodock <plik.dpf> [kolejka]
np.
> sub-autogrid test.gpf normal > sub-autodock test.dpf normal
Dokumentacja
Zobacz też:
- Oprogramowanie KDM
- System kolejkowy PBS
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|