Gromada

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe

Gromada
noframe
Kontakt
gromada @ kdm.wcss.wroc.pl

Gromada - klaster składający się z węzła dostępowego HP rx2600 oraz 32 dwuprocesorowych węzłów obliczeniowych Intel Tiger2 (łącznie 64 CPU) spiętych siecią InfiniBand (Mellanox) o przepływności 10Gbps i siecią Gigabit Ethernet przy użyciu przełącznika 3Com SuperStack 3870. Klaster w całości znajduje się w szafach rack 19". Wszytkie komputery pracują pod kontrolą systemu operacyjnego Linux Rocks.

Zestawienie

klaster :
moc obliczeniowa :
węzły :
procesory :
L3 cache :
pamięć :
dysk /home :
dysk /scratch :
system operacyjny :

gromada.wcss.wroc.pl
368,8 GFlops
dostępowy
2x Itanium2 1.3GHz
3MB
4 GB DDR/266
500 GB (SAN)
-
Linux Rocks



obliczeniowe (32)
2x Itanium2 1.4GHz
3MB
4 GB DDR/266
-
140 GB
Linux Rocks

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, ADF, Autodock, CPMD, GAMESS, Gaussian, MOLCAS, MSC.Marc, MSC.Mentat

Kompilatory

GNU GCC, Intel

Biblioteki

LAM-MPI, MPICH, OpenMP, MKL, GotoBLAS, ...

System kolejkowania

OpenPBS

Uwagi

Katalogi robocze

Jeśli użytkownik będzie musiał "ręcznie" usunąć pliki z katalogu roboczego (/scratch), należy najpierw wykonać komendę:

> cluster-fork ls -l /scratch/$USER/

Wydrukowana zostanie zawartość katalogów roboczych użytkownika na wszystkich węzłach klastra. Należy znaleźć węzeł z szukanymi plikami (np. compute-1-13) a następnie zalogować się na ten węzeł:

> ssh compute-1-13

Następnie skasować poszukiwane pliki:

> rm -rfv /scratch/$USER/plik*

Zalecenia dla użytkowników

  • Dane, dla których nie muszą być utrzymywane kopie zapasowe (backup ;), proszę trzymać na dysku /scratch na leo.
  • Nie wolno uruchamiać obliczeń generujacych duże pliki wyników w katalogach domowych, ze względu na obciążanie systemu NFS. Proszę używać do tego celu dysków lokalnych /scratch.


Zobacz też: Maszyny obliczeniowe