Kompilacja aplikacji równoległych: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 24: | Linia 24: | ||
*kompilator C - icc | *kompilator C - icc | ||
*kompilator C++ - icpc | *kompilator C++ - icpc | ||
| − | *kompilator | + | *kompilator FORTRAN77 - ifort |
| + | *kompilator FORTRAN90 - ifort | ||
Sprzężone z nimi w wrapery to: | Sprzężone z nimi w wrapery to: | ||
| Linia 31: | Linia 32: | ||
*kompilator FORTRAN77 - mpif77 | *kompilator FORTRAN77 - mpif77 | ||
*kompilator FORTRAN90 - mpif90 | *kompilator FORTRAN90 - mpif90 | ||
| + | |||
| + | {| class="wikitable" style="text-align:right" | ||
| + | |+ Tytuł tabeli. Pojawia się bez ramki | ||
| + | nad tabelą i jest wycentrowany | ||
| + | ! Pierwsza kolumna | ||
| + | ! Druga kolumna | ||
| + | |- | ||
| + | | Komórka 1, wiersz 1 | ||
| + | | Komórka 2, wiersz 1 | ||
| + | |- | ||
| + | | Komórka 1, wiersz 2 | ||
| + | | Komórka 2, wiersz 2 | ||
| + | |- | ||
| + | | Komórka 1, wiersz 3 | ||
| + | | Komórka 2, wiersz 3 | ||
| + | |- | ||
| + | | Komórka 1, wiersz 4 | ||
| + | | Komórka 2, wiersz 4 | ||
| + | |} | ||
Wersja z 13:46, 30 sie 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Kompilacja aplikacji równoległych
Znakomita większość oprogramowania na klastrze zainstalowana jest tak, aby korzystała z któregoś z protokołów wymiany informacji między procesami (mpi, OpenMP, PVM). Podczas kompilacji rónoległych aplikacji należy odnieść się, odpowiednio konfigurując srodowisko systemowe, do bibliotek wspomnianych wyżej protokołów.
Odpowiednie ustawienie środowiska pracy polega na:
- załadowaniu modułu dla wybranego kompilatora np.
module load intel/12.0 intel/12.0 load complete
- załadowaniu odpowiednich bibiliotek mpi-owych np.
module load mvapich2/1.5.1p1 mvapich2/1.5.1p1 load complete Należy pamiętać, aby biblioteki mpi-owe zostały zbudowane wersją kompilatora, na kŧórą wskazują
zmienne środowiskowe.
- załadowabnie innych bibliotek wymaganych przez kompilowaną aplikację, na przykład matematycznych:
module load mkl/12.0.1.107 mkl/12.0.1.107 load complete
Proces kompilacji
Najłatwiej skorzystać z wrapera. Wraper to skrypt, który odwołuje się do właściewego kompilatora i ustawia za użytkownika odpowiednie opcje. Opcje związane są m.in. ze sposobem linkowania współdzielonych_bibliotek(shared objects) mpi-owych.
Pakiet kompilatorów zainstalowanych na klastrze "intel" zawiera nastepujące elementy:
- kompilator C - icc
- kompilator C++ - icpc
- kompilator FORTRAN77 - ifort
- kompilator FORTRAN90 - ifort
Sprzężone z nimi w wrapery to:
- kompilator C - mpicc
- kompilator C++ - mpicxx
- kompilator FORTRAN77 - mpif77
- kompilator FORTRAN90 - mpif90
| Pierwsza kolumna | Druga kolumna |
|---|---|
| Komórka 1, wiersz 1 | Komórka 2, wiersz 1 |
| Komórka 1, wiersz 2 | Komórka 2, wiersz 2 |
| Komórka 1, wiersz 3 | Komórka 2, wiersz 3 |
| Komórka 1, wiersz 4 | Komórka 2, wiersz 4 |