NBO: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 22: Linia 22:
 
* użycie NBO wraz z GAMESS'em 2013 możliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu jednego z następujących skryptów:
 
* użycie NBO wraz z GAMESS'em 2013 możliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu jednego z następujących skryptów:
 
sub-gamess lub sub-gamess-2013.05.01-R1  
 
sub-gamess lub sub-gamess-2013.05.01-R1  
 +
 +
=== NBO w sieci ===
 +
* [https://www.chem.wisc.edu/~nbo5/ Strona domowa NBO]
 +
  
 
{{oprogramowanie}}
 
{{oprogramowanie}}

Wersja z 12:48, 17 lip 2014

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < NBO

NBO
Serwer Wersja
Supernova 6.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

NBO

Program NBO analizuje wieloelektronową funkcję falową pod względem lokalizacji par elektronowych cząsteczki. Wykorzystuje rozkład gęstości elektronowej, w celu określenia najbardziej trafnej struktury Lewisa.

Program determinuje:

  • Naturalny orbital atomowy (NAOs)
  • Naturalny orbital hybrydowy (NHOs)
  • Naturalny orbital wiążący (NBOs)
  • Naturalnie zlokalizowany orbital molekularny (NLMOs)

Wstawianie zadań

  • użycie NBO wymaga załadowania modułu w skrypcie zadania lub z linii poleceń w trakcie zadania interaktywnego:
module load nbo/6.0
  • użycie NBO wraz z Gaussianem 2009 D.01 wymaga załadowania innego modułu i następnie uruchomienie g09. Zalecane jest użycie zadania interaktywnego. Jeśli zadanie g09 wymaga podania liczby procesorów lub wielkości pamięci innych niż domyślne, to należy dodać odpowiednie karty %nproc i %mem do pliku danych g09.
module load nbo/6.0-g09
g09 plik_danych.inp plik_wynikow.log
  • użycie NBO wraz z GAMESS'em 2013 możliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu jednego z następujących skryptów:

sub-gamess lub sub-gamess-2013.05.01-R1

NBO w sieci