NWChem

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe

NWCHEM jest pakietem do obliczeń metodą ab initio w dziedzinie chemii molekuralnej. Program rozwijany jest przez Molecular Sciences Software group of the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) w Pacific Northwest National Laboratory (PNNL).

Korzystanie z pakietu w WCSS

Obecnie zainstalowaną wersją pakietu NWChem jest ver. 5.1, skompilowana przy użyciu Global Arrays toolkit ver 4.1b.

Obliczenia uruchamia się poleceniem:

> sub-nwchem plik_danych.nw kolejka liczba_procesorow pamięc-w-MB

gdzie:

  • plik_danych.inp - plik z danymi programu
  • kolejka - kolejka PBS, w której ma być uruchomione zadanie (domyślnie parallel)
  • liczba_procesorow - domyślnie zadanie uruchamiane jest na 4 procesorach, jeśli parametr ten jest podany, jego wartość powinna być wielokrotnością 4.
  • pamiec-w-MB - pamięć operacyjna dla całego zadania, musi być podana w MB.

Przykład uruchomienia (kolejka parallel, zadanie 4 procesorowe, z pamięcią 7 GB):

> sub-nwchem test.nw parallel 4 7000

Dokumentacja


Zobacz też: Oprogramowanie KDM