Oprogramowanie KDM: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
m (1 wersja: H-R)
 
Linia 13: Linia 13:
 
* '''[[Programy użytkowników]]'''
 
* '''[[Programy użytkowników]]'''
 
|}
 
|}
====Zalecania ogólne, czyli co gdzie liczyć w WCSS====
+
====Zalecania ogólne====
 
 
* Zadania '''duże''' - o dużych wymaganiach pamięciowych (>16 GB RAM) i dyskowych (kilkadziesiąt GB) najlepiej liczyć na [[Leo]]
 
* Zadania '''średnie''' i '''małe''' - do 16 GB RAM i kilkadziesiąt GB dysków najlepiej liczyć na klastrze [[Nova]]
 
  
 
Najwięcej problemów sprawiają zadania wymagające dużo dysku. Jeśli zadanie generuje kilkadziesiąt (lub więcej) GB danych, to wyszukanie np. wartości całki w takim pliku może zająć więcej czasu niż jej doliczenie na szybkiej maszynie. Wtedy, w programach kwantowo-chemicznych należy używać trybu ''direct''. Dodatkowo, silne obciążenie podsystemu dyskowego komputera spowalnia całą maszynę i opóźnia realizację zadań innych użytkowników. Oczywiście zadania, których nie można uruchomić w trybie bezpośrednim (''direct''), ciągle można liczyć w WCSS. Należy jednak pamiętać, że jeśli zagrozi to przepełnieniem przestrzeni /scratch i przerwaniem działania innych zadań, to zadanie takie zostanie zabite bez ostrzeżenia.
 
Najwięcej problemów sprawiają zadania wymagające dużo dysku. Jeśli zadanie generuje kilkadziesiąt (lub więcej) GB danych, to wyszukanie np. wartości całki w takim pliku może zająć więcej czasu niż jej doliczenie na szybkiej maszynie. Wtedy, w programach kwantowo-chemicznych należy używać trybu ''direct''. Dodatkowo, silne obciążenie podsystemu dyskowego komputera spowalnia całą maszynę i opóźnia realizację zadań innych użytkowników. Oczywiście zadania, których nie można uruchomić w trybie bezpośrednim (''direct''), ciągle można liczyć w WCSS. Należy jednak pamiętać, że jeśli zagrozi to przepełnieniem przestrzeni /scratch i przerwaniem działania innych zadań, to zadanie takie zostanie zabite bez ostrzeżenia.
  
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]
 
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Wersja z 13:15, 24 wrz 2012

< Podręcznik użytkownika KDM

Na Komputerach Dużej Mocy WCSS udostępniany jest szereg programów wspomagających kadrę naukową uczelni wrocławskich w prowadzeniu pracy naukowej w efektywny i nowoczesny sposób. W przypadku dużego zapotrzebowania użytkowników na specjalistyczne oprogramowanie o przeznaczeniu naukowym, WCSS może podjąć się jego zakupu. Poza gotowymi produktami, serwery wyposażone są także w środowiska programistyczne umożliwiające użytkownikom pisanie i kompilowanie własnych programów.

Abaqus ABINIT ADF Amber ANSYSANSYS CFD:  Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] AutoDock BAGEL Beast BioviaMaterials Studio, Discovery Studio ] Cfour Comsol CP2K CPMD CRYSTAL Dalton Dask DIRAC FDS-SMV GAMESS Gaussian Gromacs IDL LumericalFDTD, MODE ] Mathcad Mathematica Matlab Molcas Molden Molpro MOPAC NAMD NBO NWChem OpenFOAM OpenMolcas Orca Quantum ESPRESSO R Rosetta SIESTA Tinker TURBOMOLE VASP VMD WIEN2k

Zalecania ogólne

Najwięcej problemów sprawiają zadania wymagające dużo dysku. Jeśli zadanie generuje kilkadziesiąt (lub więcej) GB danych, to wyszukanie np. wartości całki w takim pliku może zająć więcej czasu niż jej doliczenie na szybkiej maszynie. Wtedy, w programach kwantowo-chemicznych należy używać trybu direct. Dodatkowo, silne obciążenie podsystemu dyskowego komputera spowalnia całą maszynę i opóźnia realizację zadań innych użytkowników. Oczywiście zadania, których nie można uruchomić w trybie bezpośrednim (direct), ciągle można liczyć w WCSS. Należy jednak pamiętać, że jeśli zagrozi to przepełnieniem przestrzeni /scratch i przerwaniem działania innych zadań, to zadanie takie zostanie zabite bez ostrzeżenia.