Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania - przykłady: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
m (1 wersja: S-Ś) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | ''' | + | * '''Termin:''' 30 listopada 2009 |
| − | ''' | + | * '''Wykładowca:''' dr Bartłomiej Szyja |
Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania: | Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania: | ||
| Linia 21: | Linia 21: | ||
# http://hera.chem.tue.nl/~sbart/04_GULP.pdf | # http://hera.chem.tue.nl/~sbart/04_GULP.pdf | ||
# http://hera.chem.tue.nl/~sbart/05_GROMACS.pdf | # http://hera.chem.tue.nl/~sbart/05_GROMACS.pdf | ||
| + | |||
| + | [[Kategoria:Szkolenia]] | ||
Wersja z 14:30, 24 maj 2011
- Termin: 30 listopada 2009
- Wykładowca: dr Bartłomiej Szyja
Zastosowania dynamiki molekularnej na przykładach dostępnego oprogramowania:
- SIESTA - metoda a zarazem implementacja pozwalająca na oblieczenia struktury elektronowej i dynamiki molekularnej ab-initio dla cząsteczeki ciał stałych. Dzięki wykorzystaniu numerycznych orbitali możliwa jest symulacja dla układów zawierających nawet kilka tysięce atomów.
- CPMD - program wykorzystujący metodę Car-Parrinello do dynamiki molekularnej ab-initio.
- GULP - program umożliwiający symulacje dynamiki molekularnej z wieloma potencjałami:
- shell model - dla układów jonowych,
- embedded atom model - dla metali,
- reactive bond-order potential - dla węglowodorów,
- wiele innych pól siłowych dla pozostałych układów.
- GROMACS - uniwersalny program do dynamiki molekularnej, zaprojektowany głównie do celów biochemicznych, ale używany także do symulacji niebiologicznych układów, np. polimerów.
- ReaxFF - program wykorzystujący reaktywne pole siłowe, umożliwiający badania reakcji chemicznych za pomocą dynamiki molekularnej.
Prezentacje można pobrać korzystając z poniższych linków: Wprowadzenie:
Informacje o poszczególnych kodach: