Korzystanie z modułów
< Podręcznik użytkownika KDM < Korzystanie z modułów
Moduły - wersja domyślna
Moduł - moduły pozwalają na łatwą i szybką konfigurację środowiska sesji użytkownika. Każda wersja zainstalowanych na klastrze programów lub bibliotek produkcyjnych posiada własny moduł w formacie nazwa_aplikacji/wersja, np.gaussian/g09.E.01 . Moduły dodają odpowiednie zmienne środowiskowe lub podmieniają ich wartości. Do zmiennych środowiskowych należą standardowe w Linux-ach zmienne PATH oraz LD_LIBRARY_PATH, lecz także te, które są wyjątkowe dla aplikacji działających na klastrze.
! | Z mechanizmu należy korzystać na ui.wcss.pl lub węzłach roboczych - w zadaniach (czy to wsadowych czy interaktywnych). |
Polecenie:
- module avail - listuje dostępne moduły, polecana metoda do sprawdzenia zasobów oprogramowania
# wylistuj wszystkie dostępne moduly module avail
# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona: module avail Python
# wylistuj dostępne moduły zawężając wyniki do Pythona ignorując rozmiar znaków: module avail -i python
- module load [nazwa_modułu] - ładuje moduł [nazwa_modułu]
$ module load intel/12.1 binutils/2.25 load complete. intel/12.1 load complete. Loading intel/12.1 Loading requirement: binutils/2.25
- module list - wyświetla załadowane moduły
$ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) binutils/2.25 2) intel/12.1 Key: auto-loaded default-version
Key oznacza klucz wg którego rozróżniane są moduły, w powyższym przykładzie moduł binutils jest oznaczony jako moduł "auto-loaded" czyli załadowany jako zależność a moduł intel jest jako "default-version" czyli ten o który docelowo nam chodziło wykonując polecenie `modue load`.
- module rm [nazwa_modułu] - usuwa załadowany moduł
$ module rm binutils binutils/2.25 unload complete $ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) intel/12.1
- module purge - usuwa wszystkie moduły
Nowe moduły [4.7]
Nowe moduły zostały wprowadzone jako domyślne w dniu 04.05.2021.
Co zmieniają nowe moduły
Zmiana z wersji 3.2 (obecna) na 4.7 jest przeskokiem o kilka generacji programu i w związku z tym zmian jest bardzo wiele. Najbardziej zauważalne z punktu widzenia użytkownika to:
- dużo szybsze działanie programu
- jeżeli wynik polecenia nie mieści się na ekranie terminala jest przekierowywany do pagera (less)
- nowy bardziej szczegółowy help
- program jest bardziej gadatliwy informuje np. jakie zależności załadował z głównym modułem
- domyślny moduł jest podkreślony (po wywołaniu komendy `module avail`)
- module list pokazuje załadowane zależności w z tłem a moduł docelowy bez
- pokolorowany output
Listę zmian można zobaczyć na stronie: https://modules.readthedocs.io/en/latest/MIGRATING.html lub tu: https://github.com/cea-hpc/modules/releases/
Nowe argumenty polecenia module
! | Zostaną dopisane. Polecamy wykonać `module --help` |
Zaobserowane wady/zalety nowych modułów
Brak zgłoszonych uwag.