Orca: Różnice pomiędzy wersjami
m |
|||
| Linia 12: | Linia 12: | ||
Do prostego ustawiania środowiska programu można skorzystać z mechanizmu [[korzystanie z modułów|modułów]]: | Do prostego ustawiania środowiska programu można skorzystać z mechanizmu [[korzystanie z modułów|modułów]]: | ||
| − | + | module load orca | |
Powyższe polecenie ustawia odpowiednie ścieżki dostępu do aktualnie najnowszej wersji programu, w tym do polecenia <code>orca</code> i pozostałych poleceń wywołujących poszczególne moduły. | Powyższe polecenie ustawia odpowiednie ścieżki dostępu do aktualnie najnowszej wersji programu, w tym do polecenia <code>orca</code> i pozostałych poleceń wywołujących poszczególne moduły. | ||
| + | |||
| + | ;Uruchamianie zadań | ||
| + | Zadanie do kolejki wstawia się poleceniem: | ||
| + | |||
| + | sub-orca-seq plik_wejsciowy [kolejka] [pamiec_w_MB] | ||
| + | |||
| + | Gdzie: | ||
| + | * Parametry w nawiasach [ ] są opcjonalne | ||
| + | * Domyślne wartości: | ||
| + | ** kolejka = normal | ||
| + | ** pamiec_w_MB = 1800 | ||
=== Dokumentacja === | === Dokumentacja === | ||
Wersja z 08:42, 29 lis 2011
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
| Orca | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 2.8.0.2 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Orca - oprogramowanie chemiczne do obliczeń metodą ab initio, DFT i półempiryczne SCF-MO.
Licencja
WCSS udostępnia program do wykorzystania w celach naukowych, nie komercyjnych.
W przypadku użycia programu autorzy wymagają cytowania w publikacjach następującej pracy (p. 4 licencji):
"Neese, F. ORCA – an ab initio, Density Functional and Semiempirical program package, Version 2.5. University of Bonn, 2006."
Korzystanie
- Środowisko aplikacji
Do prostego ustawiania środowiska programu można skorzystać z mechanizmu modułów:
module load orca
Powyższe polecenie ustawia odpowiednie ścieżki dostępu do aktualnie najnowszej wersji programu, w tym do polecenia orca i pozostałych poleceń wywołujących poszczególne moduły.
- Uruchamianie zadań
Zadanie do kolejki wstawia się poleceniem:
sub-orca-seq plik_wejsciowy [kolejka] [pamiec_w_MB]
Gdzie:
- Parametry w nawiasach [ ] są opcjonalne
- Domyślne wartości:
- kolejka = normal
- pamiec_w_MB = 1800
Dokumentacja
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|