Tripos Sybyl: Różnice pomiędzy wersjami
m (- tezro) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Tripos Sybyl</small> |
| − | {{aplikacja|nazwa=SYBYL|logo=|serwer=[[ | + | {{aplikacja|nazwa=SYBYL|logo=|serwer=[[Klaster kampusowy]] |wersja=Sybyl-X 1.3 |wersja2=Sybyl-X 2.0|serwer2=Do pobrania|wersja21=Sybyl-X 1.3 |wersja22=Sybyl-X 2.0}} |
'''SYBYL''' - pakiet chemiczny firmy Tripos. SYBYL jest oprogramowaniem do modelowania molekularnego, umożliwiającym projektowanie, analizę i wizualizację struktur molekularnych. | '''SYBYL''' - pakiet chemiczny firmy Tripos. SYBYL jest oprogramowaniem do modelowania molekularnego, umożliwiającym projektowanie, analizę i wizualizację struktur molekularnych. | ||
| Linia 7: | Linia 7: | ||
'''Licencja jest ważna do 30 września 2012'''. Użytkownicy planujący wykorzystanie Sybyla po tej dacie proszeni są o zgłaszanie swoich planów [[kontakt|administratorom]]. | '''Licencja jest ważna do 30 września 2012'''. Użytkownicy planujący wykorzystanie Sybyla po tej dacie proszeni są o zgłaszanie swoich planów [[kontakt|administratorom]]. | ||
| + | |||
== Sybyl w WCSS == | == Sybyl w WCSS == | ||
| − | + | Najnowszą wersję oprogramowania Sybyl-X udostępniamy na [[klaster kampusowy|klastrze kampusowym]] oraz do zainstalowania na swoim komputerze (Windows, Mac OS, Linux). W celu ustalenia możliwości udostępnienia prosimy kontaktować się z [[kontakt|administratorami]]. | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
;Sprawdzanie dostępności modułów | ;Sprawdzanie dostępności modułów | ||
| Linia 58: | Linia 42: | ||
*ProTable | *ProTable | ||
*MatchMaker | *MatchMaker | ||
| + | | | ||
*LeapFrog | *LeapFrog | ||
*Legion | *Legion | ||
| Linia 65: | Linia 50: | ||
*MARDIGRAS+ | *MARDIGRAS+ | ||
*Almond | *Almond | ||
| − | |||
*Tuplets | *Tuplets | ||
*Fugue | *Fugue | ||
| Linia 74: | Linia 58: | ||
*Molconn-Z | *Molconn-Z | ||
*UNITY Base | *UNITY Base | ||
| + | | | ||
*UNITY 3D | *UNITY 3D | ||
*UNITY Extra Search Engine | *UNITY Extra Search Engine | ||
Wersja z 10:26, 3 wrz 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Tripos Sybyl
| SYBYL | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Klaster kampusowy | Sybyl-X 1.3 Sybyl-X 2.0 |
| Do pobrania | Sybyl-X 1.3 Sybyl-X 2.0 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
SYBYL - pakiet chemiczny firmy Tripos. SYBYL jest oprogramowaniem do modelowania molekularnego, umożliwiającym projektowanie, analizę i wizualizację struktur molekularnych.
Licencja
WCSS udostępnia pakiet SYBYL (wersja 8.0) w ramach krajowej licencji na oprogramowanie firmy Tripos, koordynowanej przez ICM (strona licencji krajowej: http://www.icm.edu.pl/kdm/Tripos).
Licencja jest ważna do 30 września 2012. Użytkownicy planujący wykorzystanie Sybyla po tej dacie proszeni są o zgłaszanie swoich planów administratorom.
Sybyl w WCSS
Najnowszą wersję oprogramowania Sybyl-X udostępniamy na klastrze kampusowym oraz do zainstalowania na swoim komputerze (Windows, Mac OS, Linux). W celu ustalenia możliwości udostępnienia prosimy kontaktować się z administratorami.
- Sprawdzanie dostępności modułów
Ponieważ Tripos Sybyl jest udostępniany w ramach licencji krajowej może się zdarzyć, że poszczególne moduły będą w danej chwili w użyciu i trzeba poczekać na zwolnienie się odpowiedniej liczby tokenów. Każdy użytkownik może sprawdzić aktualny stan wykorzystania modułów odpytując serwer licencji:
- na serwerze wykonać polecenie, np. dla tcsh:
> setenv LM_LICENSE_FILE 1705@krankenschwester.icm.edu.pl > lmstat -a
- dla wygody można wynik polecenia przekierować do pliku
> lmstat -a > sybyl.status.txt > less sybyl.status.txt
Lista modułów
|
|
|
Nowe moduły
Uwaga - wycofano oprogramowanie FlexX.
Dokumentacja
Dokumentacja on-line dostępna na serwerze usługowym KDM:
- Tripos Bookshelf (dostępna wyłącznie z komputerów sieci WASK)
- Linki zewnętrzne
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|