MOLCAS: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 28: Linia 28:
 
== Dokumentacja ==
 
== Dokumentacja ==
 
;Molcas w sieci
 
;Molcas w sieci
* http://www.teokem.lu.se/molcas/
+
* http://www.molcas.org/
  
  

Wersja z 11:53, 28 paź 2013

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molcas

Molcas
Molcas.jpg
Serwer Wersja
Supernova 7.6 i 7.8
Kontakt
kdm@wcss.pl

Molcas - oprogramowanie kwantowo-chemiczne.

Licencja jest ważna do 2 grudnia 2013 r.

Korzystanie w WCSS

Na klastrze Supernova dostępna jest wersja 7.6 i 7.8. Wersja starsza zostanie wycofana, gdyż działa niestabilnie.

Uruchamianie zadań
  • Zadanie wstawiamy skryptem sub-molcas, aby poznać składnię wywołaj skrypt bez argumentów:
sub-molcas
Sposob uzycia: sub-molcas-7.8 plik.inp liczba_procesorow pamiec_w_MB_per_procesor kolejka
   plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log
  • dla zadań w kolejce bigmem należy używać skryptu sub-molcas-7.8-bigmem:
sub-molcas-7.8-bigmem 
Sposob uzycia: /usr/local/bin/sub-molcas-7.8-bigmem plik.inp liczba_rdzeni pamiec_w_MB_per_cale_zadanie
   plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log


Uwagi

Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 83% zadeklarowanej wartości w systemie PBS. Przykładowo, jeśli wyspecyfikujemy 1800 MB per procesor, to MOLCASMEM przyjmie wartość 1500mb.

Dokumentacja

Molcas w sieci


Zobacz też: Oprogramowanie KDM