Bem: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(Utworzono nową stronę "<small>< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem</small> {{note|Klaster jest w trakcie przygotowania do udostępnienia użytkownikom WCSS}} {{s...") |
(→Zalecenia: zmiana polecenia quota aby wskazywała na ~) |
||
| (Nie pokazano 30 wersji utworzonych przez 7 użytkowników) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Maszyny obliczeniowe]] < Bem</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Maszyny obliczeniowe]] < Bem</small> | ||
| − | {{note| | + | <!--{{note|Przerwa serwisowa klastra: 17 sierpnia - 21 sierpnia 2015}}--> |
{{serwer | {{serwer | ||
|nazwa=Bem | |nazwa=Bem | ||
| Linia 6: | Linia 6: | ||
|admini=kdm@wcss.pl | |admini=kdm@wcss.pl | ||
}} | }} | ||
| − | '''Bem''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]] w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon | + | '''Bem''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]] w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell). |
| − | + | === Parametry klastra === | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | + | * węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: '''bem.wcss.pl''', | |
| − | * | + | * węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: '''ui.wcss.pl''', |
| − | * | + | * 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell), |
| − | * | + | * 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell), |
| − | * | + | * 182 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell), |
| − | * | + | * 10 węzłów obliczeniowych 28-rdzeniowych z 512 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell), |
| − | * moc obliczeniowa | + | * 22 656 rdzeni obliczeniowych, |
| + | * 74,6 TB pamięci RAM, | ||
| + | * przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS, | ||
| + | * przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre, | ||
| + | * sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1), | ||
| + | * sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G, | ||
| + | * system operacyjny: Linux CentOS 6, | ||
| + | * moc obliczeniowa: 860 TFLOPS. | ||
| − | ===Oprogramowanie=== | + | Pamięć operacyjna dostępna dla zadań obliczeniowych jest mniejsza niż pamięć zainstalowana fizycznie i wynosi: |
| + | * dla węzłów z zainstalowanymi 64 GB pamięci fiz. - 60000 MB, | ||
| + | * dla węzłów z zainstalowanymi 128 GB pamięci fiz. - 125000 MB, | ||
| + | * dla węzłów z zainstalowanymi 512 GB pamięci fiz. - 500000 MB. | ||
| + | |||
| + | === Oprogramowanie === | ||
;Aplikacje | ;Aplikacje | ||
| − | [[Abaqus]], [[ADF]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[CRYSTAL09]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[NWChem]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]] | + | [[Abaqus]], [[ABINIT]], [[ADF]], [[Amber]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[Cfour]], [[Comsol]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[DIRAC]], [[FDS-SMV]], [[GAMESS]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Lumerical]] [ [[Lumerical FDTD|FDTD]], [[Lumerical MODE|MODE]] ], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TensorFlow]], [[TURBOMOLE]] i [[Oprogramowanie_naukowe|inne]] oraz aplikacje własne użytkowników. |
;Kompilatory | ;Kompilatory | ||
| − | [[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]] | + | [[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]] i [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|inne]]. |
;Biblioteki i narzędzia | ;Biblioteki i narzędzia | ||
| − | * OpenMPI | + | * OpenMPI, |
| − | * HDF, HDF5 | + | * HDF, HDF5, |
| − | * NetCDF | + | * NetCDF, |
| − | * Python + SciPy + NumPy | + | * Python + SciPy + NumPy, |
| + | * [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|pozostałe]]. | ||
;System kolejkowania | ;System kolejkowania | ||
| − | [[PBSPro]] | + | [[PBSPro]]. |
| + | |||
| + | ===Zalecenia=== | ||
| + | |||
| + | Na dysku /home wprowadzone są kwoty dyskowe: domyślny limit wynosi 50 GB. Sprawdzenie stanu: | ||
| + | quota -s -f ~ | ||
| + | Podręcznik systemowy dla polecenia quota: | ||
| + | man quota | ||
===Zobacz też=== | ===Zobacz też=== | ||
| − | |||
*[[Maszyny obliczeniowe]] | *[[Maszyny obliczeniowe]] | ||
Aktualna wersja na dzień 11:20, 16 mar 2022
< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem
| Bem |
|---|
 |
| Kontakt |
| kdm@wcss.pl |
Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell).
Parametry klastra
- węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: bem.wcss.pl,
- węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: ui.wcss.pl,
- 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
- 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
- 182 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
- 10 węzłów obliczeniowych 28-rdzeniowych z 512 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
- 22 656 rdzeni obliczeniowych,
- 74,6 TB pamięci RAM,
- przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS,
- przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
- sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
- sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
- system operacyjny: Linux CentOS 6,
- moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.
Pamięć operacyjna dostępna dla zadań obliczeniowych jest mniejsza niż pamięć zainstalowana fizycznie i wynosi:
- dla węzłów z zainstalowanymi 64 GB pamięci fiz. - 60000 MB,
- dla węzłów z zainstalowanymi 128 GB pamięci fiz. - 125000 MB,
- dla węzłów z zainstalowanymi 512 GB pamięci fiz. - 500000 MB.
Oprogramowanie
- Aplikacje
Abaqus, ABINIT, ADF, Amber, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, Cfour, Comsol, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, DIRAC, FDS-SMV, GAMESS, Gaussian, Gromacs, LAMMPS, Lumerical [ FDTD, MODE ], Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TensorFlow, TURBOMOLE i inne oraz aplikacje własne użytkowników.
- Kompilatory
- Biblioteki i narzędzia
- OpenMPI,
- HDF, HDF5,
- NetCDF,
- Python + SciPy + NumPy,
- pozostałe.
- System kolejkowania
Zalecenia
Na dysku /home wprowadzone są kwoty dyskowe: domyślny limit wynosi 50 GB. Sprawdzenie stanu:
quota -s -f ~
Podręcznik systemowy dla polecenia quota:
man quota
Zobacz też
| Maszyny obliczeniowe | Bem ⋅ Klaster kampusowy |
|---|