APBS: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(→APBS) |
(→APBS) |
||
| Linia 6: | Linia 6: | ||
''' APBS (Adaptive Poisson-Boltzmann Solver)''' - pakiet umożliwiający ocenę własciwości elektrostatycznych w układach biomolekularnych. | ''' APBS (Adaptive Poisson-Boltzmann Solver)''' - pakiet umożliwiający ocenę własciwości elektrostatycznych w układach biomolekularnych. | ||
| − | Aplikacja m.in. służy do modelowania otoczki solwatacyjnej. Wykorzystuje model Poissona-Boltzmanna (PBE) opisujący oddziaływania niewiążące w | + | Aplikacja m.in. służy do modelowania otoczki solwatacyjnej. Wykorzystuje model Poissona-Boltzmanna (PBE) opisujący oddziaływania niewiążące w środowisku o określonym pH. |
Rejony zastosowań: | Rejony zastosowań: | ||
Wersja z 13:06, 17 cze 2010
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe
|
APBS - oprogramowanie
APBS
APBS (Adaptive Poisson-Boltzmann Solver) - pakiet umożliwiający ocenę własciwości elektrostatycznych w układach biomolekularnych.
Aplikacja m.in. służy do modelowania otoczki solwatacyjnej. Wykorzystuje model Poissona-Boltzmanna (PBE) opisujący oddziaływania niewiążące w środowisku o określonym pH.
Rejony zastosowań:
- symulacja procesów dyfuzji w celu pomiaru kinetyki np. białko - białko, ligand - białko
- symulacja z uwzględniniem dynamiki molekularnej rozpuszczalnika
- kalkulacja energii wiązania i energii solwatacji
- miareczkowanie białek