Quantum ESPRESSO: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 5: | Linia 5: | ||
Na klastrze [[Bem]] dostępne są różne wersje QE. | Na klastrze [[Bem]] dostępne są różne wersje QE. | ||
| − | + | Po uruchomieniu [[Jak_korzystać_z_kolejek_PBS#Uruchomienie_zadania_interaktywnego|zadania interaktywnego]], np.: | |
| + | |||
| + | qsub -I -l walltime=6:00:00 -l select=1:ncpus=1:mem=2048MB -l software=Quantum_ESPRESSO_6.4.1 | ||
| + | |||
| + | należy załadować jeden z wybranych modułów w powłoce: | ||
> module load espresso/5.4.0-intel16.0 | > module load espresso/5.4.0-intel16.0 | ||
> module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0 | > module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0 | ||
| Linia 11: | Linia 15: | ||
> module load espresso/6.3 | > module load espresso/6.3 | ||
> module load QuantumESPRESSO/6.4.1-intel-2019a | > module load QuantumESPRESSO/6.4.1-intel-2019a | ||
| + | |||
| + | Po załadowaniu modułu należy wywołać jeden wielu z programów wykonywalnych (poniższe są dostępne w wersji 6.4.1): | ||
| + | |||
| + | PWscf (pw.x) | ||
| + | PHonon (ph.x, dynmat.x) | ||
| + | PWneb (neb.x) | ||
| + | PWCOND (pwcond.x) | ||
| + | CP (cp.x) | ||
| + | TurboTDDFT (turbo_lanczos.x, turbo_spectrum.x, turbo_davidson.x, turbo_eels.x) | ||
| + | XSpectra (xspectra.x) | ||
| + | atomic (ld1.x) | ||
| + | hp.x | ||
| + | |||
| + | Postprocessings : | ||
| + | |||
| + | pp.x | ||
| + | dos.x | ||
| + | bands.x | ||
| + | projwfc.x | ||
| + | molecularpdos.x | ||
| + | cppp.x | ||
| + | pw_export.x | ||
| + | ppacf.x | ||
| + | |||
| + | bezpośrednio po nazwie programu: | ||
| + | |||
| + | pw.x < file.in | ||
| + | |||
| + | |||
| + | lub w sposób zrównoleglony np.: | ||
| + | |||
| + | mpirun -np x pw.x -i file.in | ||
| + | |||
| + | gdzie: | ||
| + | |||
| + | x - liczba zrównoleglanych procesów | ||
| + | |||
| + | file.in - plik inputowy | ||
Wersja z 09:07, 14 sty 2020
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < BAGEL
| Quantum ESPRESSO | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Bem | 5.4.0 6.2.1 6.3 6.4.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
QE (Quantum ESPRESSO) - zintegrowany pakiet Open Source do obliczeń struktury elektronowej i modelowania materiałów w nanoskali. Opiera się na teorii funkcjonału gęstości, falach płaskich i pseudopotencjach.
Na klastrze Bem dostępne są różne wersje QE.
Po uruchomieniu zadania interaktywnego, np.:
qsub -I -l walltime=6:00:00 -l select=1:ncpus=1:mem=2048MB -l software=Quantum_ESPRESSO_6.4.1
należy załadować jeden z wybranych modułów w powłoce:
> module load espresso/5.4.0-intel16.0 > module load espresso/5.4.0-yambo-intel16.0 > module load espresso/6.2.1 > module load espresso/6.3 > module load QuantumESPRESSO/6.4.1-intel-2019a
Po załadowaniu modułu należy wywołać jeden wielu z programów wykonywalnych (poniższe są dostępne w wersji 6.4.1):
PWscf (pw.x) PHonon (ph.x, dynmat.x) PWneb (neb.x) PWCOND (pwcond.x) CP (cp.x) TurboTDDFT (turbo_lanczos.x, turbo_spectrum.x, turbo_davidson.x, turbo_eels.x) XSpectra (xspectra.x) atomic (ld1.x) hp.x
Postprocessings :
pp.x dos.x bands.x projwfc.x molecularpdos.x cppp.x pw_export.x ppacf.x
bezpośrednio po nazwie programu:
pw.x < file.in
lub w sposób zrównoleglony np.:
mpirun -np x pw.x -i file.in
gdzie:
x - liczba zrównoleglanych procesów
file.in - plik inputowy
- Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
- QE w sieci
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|