NWChem: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 2: Linia 2:
 
{{zasobytab|logo=|serwery=[[Nova]]}}
 
{{zasobytab|logo=|serwery=[[Nova]]}}
 
'''NWCHEM''' jest  pakietem do obliczeń metodą ''ab initio'' w dziedzinie chemii molekuralnej. Program rozwijany jest przez Molecular Sciences Software group of the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) w  Pacific Northwest National Laboratory (PNNL).
 
'''NWCHEM''' jest  pakietem do obliczeń metodą ''ab initio'' w dziedzinie chemii molekuralnej. Program rozwijany jest przez Molecular Sciences Software group of the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) w  Pacific Northwest National Laboratory (PNNL).
 
== Informacje ogólne ==
 
Opis funkcjonalności znajduje się na stronie domowej projektu: [http://www.emsl.pnl.gov/docs/nwchem/capabilities/nwchem_capab.html NWChem Home Page]
 
  
 
== Korzystanie z pakietu w WCSS ==
 
== Korzystanie z pakietu w WCSS ==
Linia 22: Linia 19:
  
 
  > sub-nwchem test.nw parallel 4 7000
 
  > sub-nwchem test.nw parallel 4 7000
 +
 +
== Dokumentacja ==
 +
* [http://www.emsl.pnl.gov/docs/nwchem/capabilities/nwchem_capab.html Strona domowa pakietu NWChem]
 +
* [http://www.emsl.pnl.gov/capabilities/computing/nwchem/docs/usermanual.pdf Podręcznik użytkownika NWChem]
  
  

Wersja z 11:50, 4 mar 2010

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe

NWCHEM jest pakietem do obliczeń metodą ab initio w dziedzinie chemii molekuralnej. Program rozwijany jest przez Molecular Sciences Software group of the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) w Pacific Northwest National Laboratory (PNNL).

Korzystanie z pakietu w WCSS

Obecnie zainstalowaną wersją pakietu NWChem jest ver. 5.1, skompilowana przy użyciu Global Arrays toolkit ver 4.1b.

Obliczenia uruchamia się poleceniem:

> sub-nwchem plik_danych.nw kolejka liczba_procesorow pamięc-w-MB

gdzie:

  • plik_danych.inp - plik z danymi programu
  • kolejka - kolejka PBS, w której ma być uruchomione zadanie (domyślnie parallel)
  • liczba_procesorow - domyślnie zadanie uruchamiane jest na 4 procesorach, jeśli parametr ten jest podany, jego wartość powinna być wielokrotnością 4.
  • pamiec-w-MB - pamięć operacyjna dla całego zadania, musi być podana w MB.

Przykład uruchomienia (kolejka parallel, zadanie 4 procesorowe, z pamięcią 7 GB):

> sub-nwchem test.nw parallel 4 7000

Dokumentacja


Zobacz też: Oprogramowanie KDM