R: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 1: Linia 1:
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < R</small>
 
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < R</small>
{{aplikacja|nazwa=R|logo= |serwer=[[Supernova]]|wersja=3.0.2|wersja3=2.14}}
+
{{aplikacja|nazwa=R|logo= |serwer=[[Supernova]]|wersja=3.1.0|wersja2=3.0.2|wersja3=2.14}}
  
 
'''GNU R''' jest językiem programowania i środowiskiem do obliczeń statystycznych i wizualizacji wyników.
 
'''GNU R''' jest językiem programowania i środowiskiem do obliczeń statystycznych i wizualizacji wyników.
Linia 6: Linia 6:
 
=== R w WCSS ===
 
=== R w WCSS ===
 
;Wstawianie zadań do kolejki:
 
;Wstawianie zadań do kolejki:
dla R 3.0.2:
+
dla R 3.1.0:
  
 
  '''sub-R''' plik.inp [kolejka] [ilosc_pamieci_w_MB]
 
  '''sub-R''' plik.inp [kolejka] [ilosc_pamieci_w_MB]
Linia 14: Linia 14:
 
Uruchamianie zadań poza kolejką jest zabronione.
 
Uruchamianie zadań poza kolejką jest zabronione.
  
==== Zainstalowane pakiety (w wersji 3.0.2) ====
+
==== Zainstalowane pakiety ====
{|
+
Listę dostępnych rozszerzeń można sprawdzić poleceniem:
|
+
<pre>
    abind
+
installed.packages()
    acepack
+
</pre>
    ade4
+
po uruchomienu R w trybie interaktywnym.
    ADGofTest
 
    akima
 
    ALL
 
    annotate
 
    AnnotationDbi
 
    AnnotationForge
 
    apcluster
 
    aplpack
 
    base
 
    Biobase
 
    BiocGenerics
 
    BiocInstaller
 
    biomaRt
 
    Biostrings
 
    biovizBase
 
    bitops
 
    blockmodeling
 
    blotter
 
    boot
 
    Boruta
 
    BSgenome
 
    car
 
    caret
 
    Category
 
    caTools
 
    cclust
 
    chron
 
    class
 
    cluster
 
    clusterSim
 
    clv
 
    clValid
 
    cobs
 
    coda
 
    codetools
 
    colorspace
 
    compHclust
 
    compiler
 
    copula
 
    cubature
 
    cummeRbund
 
    datasets
 
    DBI
 
    ddst
 
    Defaults
 
    DESeq
 
    DESeq2
 
|
 
    dichromat
 
    digest
 
    DistributionUtils
 
    doMC
 
    doMPI
 
    dynamicTreeCut
 
    e1071
 
    EBSeq
 
    edgeR
 
    effects
 
    EMCluster
 
    etm
 
    evaluate
 
    evd
 
    expm
 
    fastcluster
 
    fBasics
 
    FEAR
 
    fGarch
 
    FinancialInstrument
 
    flashClust
 
    flexmix
 
    foreach
 
    foreign
 
    formatR
 
    Formula
 
    fpc
 
    gam
 
    gdata
 
    geepack
 
    genefilter
 
    geneplotter
 
    GeneralizedHyperbolic
 
    GenomicFeatures
 
    GenomicRanges
 
    GEOquery
 
    getopt
 
    ggplot2
 
    GO.db
 
    GOstats
 
    gplots
 
    graph
 
    graphics
 
    grDevices
 
    grid
 
    GSEABase
 
    gsl
 
    gss
 
    gstat
 
    gtable
 
|
 
    gtools
 
    gumbel
 
    Gviz
 
    hgu95av2.db
 
    highr
 
    Hmisc
 
    hybridHclust
 
    igraph
 
    intervals
 
    IRanges
 
    isopam
 
    iterators
 
    kernlab
 
    KernSmooth
 
    kknn
 
    knitr
 
    ks
 
    labeling
 
    lattice
 
    latticeExtra
 
    leaps
 
    limma
 
    lmtest
 
    locfit
 
    markdown
 
    MASS
 
    Matrix
 
    matrixcalc
 
    mclust
 
    methods
 
    mgcv
 
    misc3d
 
    mixtools
 
    mnormt
 
    modeltools
 
    msm
 
    multcomp
 
    multcompView
 
    multicool
 
    multicore
 
    multtest
 
    munsell
 
    mvtnorm
 
    NbClust
 
    nlme
 
    nloptr
 
    nlts
 
    nnet
 
    np
 
    numDeriv
 
|
 
    org.Hs.eg.db
 
    orthopolynom
 
    parallel
 
    PerformanceAnalytics
 
    permute
 
    plyr
 
    polynom
 
    proj4
 
    proto
 
    pscl
 
    pspline
 
    pvclust
 
    quadprog
 
    quantmod
 
    quantreg
 
    quantstrat
 
    R2HTML
 
    R2OpenBUGS
 
    randomForest
 
    RBGL
 
    Rcmdr
 
    RColorBrewer
 
    Rcpp
 
    RcppArmadillo
 
    RCurl
 
    relimp
 
    reshape
 
    reshape2
 
    rFerns
 
    rgdal
 
    rgeos
 
    rgl
 
    Rgraphviz
 
    rjags
 
    rjson
 
    Rmpi
 
    RMySQL
 
    RODBC
 
    rpart
 
    Rsamtools
 
    RSNNS
 
    Rsolnp
 
    RSQLite
 
    rtape
 
    rtracklayer
 
    rugarch
 
    RUnit
 
    sandwich
 
    scales
 
    scatterplot3d
 
|valign=top|
 
    segmented
 
    sem
 
    sigclust
 
    SkewHyperbolic
 
    sn
 
    snow
 
    sp
 
    spacetime
 
    SparseM
 
    spatial
 
    spd
 
    splines
 
    stabledist
 
    stats
 
    stats4
 
    stringr
 
    survival
 
    tcltk
 
    tcltk2
 
    TH.data
 
    timeDate
 
    timeSeries
 
    tools
 
    trio
 
    truncnorm
 
    TSA
 
    tseries
 
    TTR
 
    utils
 
    vcd
 
    vegan
 
    XML
 
    xtable
 
    xts
 
    XVector
 
    zlibbioc
 
    zoo
 
|}
 
 
Przed użyciem danego pakietu proszę zapoznać się z wymogami licencyjnymi i/lub obowiązkiem cytowania.
 
Przed użyciem danego pakietu proszę zapoznać się z wymogami licencyjnymi i/lub obowiązkiem cytowania.
  

Wersja z 06:31, 17 kwi 2014

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < R

R
Serwer Wersja
Supernova 3.1.0
3.0.2
2.14
Kontakt
kdm@wcss.pl


GNU R jest językiem programowania i środowiskiem do obliczeń statystycznych i wizualizacji wyników.

R w WCSS

Wstawianie zadań do kolejki

dla R 3.1.0:

sub-R plik.inp [kolejka] [ilosc_pamieci_w_MB]

Po zakończeniu obliczeń zostanie wysłany mail na adres podany przy rejestracji konta, a w katalogu z plikiem wejściowym pojawią się pliki: nazwa_pliku.oXXXXX i nazwa_pliku.eXXXXX, zawierające kolejno, wynik działania programu (STDOUT) i powstałe błędy (STDERR), XXXXX to jest liczba będąca numerem zadania w kolejce.

Uruchamianie zadań poza kolejką jest zabronione.

Zainstalowane pakiety

Listę dostępnych rozszerzeń można sprawdzić poleceniem:

installed.packages()

po uruchomienu R w trybie interaktywnym. Przed użyciem danego pakietu proszę zapoznać się z wymogami licencyjnymi i/lub obowiązkiem cytowania.

R w sieci