MOPAC: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 19: | Linia 19: | ||
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci. | Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci. | ||
| − | + | === Informacje o wykorzystaniu === | |
| + | {{Podziękowanie_WCSS}} | ||
=== MOPAC w sieci === | === MOPAC w sieci === | ||
* [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu] | * [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu] | ||
Wersja z 12:24, 21 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < MOPAC
| MOPAC | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 7.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
MOPAC2009 - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.
MOPAC w WCSS
Pakiet zainstalowany jest na klastrze Supernova.
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako zadanie interaktywne:
qsub -I -l software=Mopac
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego modułu:
module load mopac
Program można wywoływać poleceniem:
mopac plik.mop
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując:
sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ]
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki normal z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci.
Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
MOPAC w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|