MOLCAS

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molcas

Licencja WCSS wygasła z dniem 2 grudnia 2013 r. Z programu mogą korzystać użytkownicy i zespoły posiadające własną licencję.

Molcas
Serwer	Wersja
Supernova	7.6 i 7.8
Kontakt
kdm@wcss.pl

Molcas - oprogramowanie kwantowo-chemiczne.

Korzystanie w WCSS

Na klastrze Supernova dostępna jest wersja 7.6 i 7.8. Wersja starsza zostanie wycofana, gdyż działa niestabilnie.

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

Instalacja własnej licencji

Jeśli użytkownik posiada własną licencję może skonfigurować środowisko na klastrze do korzystania z niej. Należy skopiować plik licencji na klaster, następnie założyć w swoim katalogu domowym na klastrze katalog .Molcas (z kropką na początku) i skopiować do niego plik licencji license.dat.

> cd
> mkdir .Molcas
> cp license.dat .Molcas/

Uruchamianie zadań

Zadanie wstawiamy skryptem /usr/local/bin/old/sub-molcas (skrypt uruchamia wersję 7.8), aby poznać składnię należy wywołać skrypt bez argumentów:

> /usr/local/bin/old/sub-molcas
Sposob uzycia: /usr/local/bin/old/sub-molcas plik.inp liczba_procesorow pamiec_w_MB_per_procesor kolejka
   plik.inp - plik z danymi wejsciowymi, wyniki w plik.log

Uwaga

Zmienna MOLCASMEM przydzielana jest w ten sposób, że stanowi ok. 75% pamięci zadeklarowanej w kolejce. Przykładowo: jeśli wstawimy zadanie do kolejki na 1000MB per rdzeń, to zmienna MOLCASMEM zostanie ustawiona na 750MB. Przeszacowanie pamięci spowoduje, że zadanie będzie dłużej czekać w kolejce oraz MOLCAS będzie działał wolniej.

Dokumentacja

Molcas w sieci

• http://www.molcas.org/

Zobacz też: Oprogramowanie KDM