Catalyst: Różnice pomiędzy wersjami
m |
|||
| (Nie pokazano 6 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]]</small> | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < [[Accelrys]] < Catalyst</small> |
| − | {{aplikacja|nazwa=Catalyst|logo=|serwer=[[Tezro]]|wersja=4.80}} | + | {{Note|Pakiet, w związku z wycofaniem z użytku komputera [[Tezro]], nie jest już dostępny w WCSS.}} |
| − | '''Catalyst''' - oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]]. Pakiet szczególnie przydatny podczas opracowywania struktury chemicznej leków. Wersja pakietu udostępniana na Tezro jest już | + | {{aplikacja|nazwa=Catalyst|logo=[[Plik:Accelrys_logo.gif|133px]] |serwer=[[Tezro]]|wersja=4.80 |kontakt=admin@kdm.wcss.wroc.pl}} |
| + | '''Catalyst''' - spadkowe oprogramowanie chemiczne firmy [[Accelrys]], obecnie funkcjonalności produktu Catalyst rozwijane są w powiązaniu z pakietem [[Discovery Studio]] i Pipeline Pilot. Pakiet szczególnie przydatny podczas opracowywania struktury chemicznej leków. Wersja pakietu udostępniana na komputerze [[Tezro]] nie jest już rozwijana przez producenta. | ||
| − | ====Uruchamianie aplikacji | + | == Licencja == |
| + | Funkcjonalności produktu InsightII rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys [[Discovery Studio]]. W związku z tym, produkt dostępny jest w ograniczonym zakresie. | ||
| + | |||
| + | === Informacje o wykorzystaniu === | ||
| + | {{Podziękowanie_WCSS}} | ||
| + | |||
| + | ==Uruchamianie aplikacji== | ||
Obliczenia testowe należy wstawiać do kolejek z grupy short. Poszczególne programy uruchamia się używając jednej z komend (lokalizacja: /usr/local/bin): | Obliczenia testowe należy wstawiać do kolejek z grupy short. Poszczególne programy uruchamia się używając jednej z komend (lokalizacja: /usr/local/bin): | ||
| Linia 9: | Linia 16: | ||
> '''catalyst_480''' | > '''catalyst_480''' | ||
| − | + | === Wstawianie zadań do kolejki === | |
| − | Zadania należy uruchamiać posługując się poleceniem [[OpenPBS|PBS]] '''qsub''', bliżej omówionym w artykule [[ | + | Zadania należy uruchamiać posługując się poleceniem [[OpenPBS|PBS]] '''qsub''', bliżej omówionym w artykule [[Jak korzystać z kolejek PBS]]. |
| − | + | == Dokumentacja == | |
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6. | Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w [[WCSS]], pok. 6. | ||
;Catalyst w sieci: | ;Catalyst w sieci: | ||
| − | * [http://www.accelrys.com/products/catalyst Catalyst] | + | * [http://www.accelrys.com/products/catalyst Catalyst] - strona niedostępna, produkt został wycofany ze sprzedaży. |
| − | * [http://accelrys.com/products/pipeline-pilot/component-collections/catalyst.html Nowy Catalyst | + | * [http://accelrys.com/products/pipeline-pilot/component-collections/catalyst.html Nowy Catalyst] (wymaga [[Discovery Studio]] i Pipeline Pilot) |
'''Zobacz też''' : [[Accelrys|Licencja i żetony]] | '''Zobacz też''' : [[Accelrys|Licencja i żetony]] | ||
| Linia 24: | Linia 31: | ||
{{oprogramowanie}} | {{oprogramowanie}} | ||
| − | [[Kategoria:Oprogramowanie]] | + | [[Kategoria:Oprogramowanie obecnie niewspierane]] |
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | [[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | ||
Aktualna wersja na dzień 11:31, 22 paź 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Accelrys < Catalyst
| ! | Pakiet, w związku z wycofaniem z użytku komputera Tezro, nie jest już dostępny w WCSS. |
| Catalyst | |
|---|---|
| |
| Serwer | Wersja |
| Tezro | 4.80 |
| Kontakt | |
| admin@kdm.wcss.wroc.pl | |
Catalyst - spadkowe oprogramowanie chemiczne firmy Accelrys, obecnie funkcjonalności produktu Catalyst rozwijane są w powiązaniu z pakietem Discovery Studio i Pipeline Pilot. Pakiet szczególnie przydatny podczas opracowywania struktury chemicznej leków. Wersja pakietu udostępniana na komputerze Tezro nie jest już rozwijana przez producenta.
Licencja
Funkcjonalności produktu InsightII rozwijane są w nowym pakiecie firmy Accelrys Discovery Studio. W związku z tym, produkt dostępny jest w ograniczonym zakresie.
Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
Uruchamianie aplikacji
Obliczenia testowe należy wstawiać do kolejek z grupy short. Poszczególne programy uruchamia się używając jednej z komend (lokalizacja: /usr/local/bin):
> catalyst (domyślnie najnowsza wersja pakietu) > catalyst_480
Wstawianie zadań do kolejki
Zadania należy uruchamiać posługując się poleceniem PBS qsub, bliżej omówionym w artykule Jak korzystać z kolejek PBS.
Dokumentacja
Dokumentacja w formie książkowej dostępna jest w WCSS, pok. 6.
- Catalyst w sieci
- Catalyst - strona niedostępna, produkt został wycofany ze sprzedaży.
- Nowy Catalyst (wymaga Discovery Studio i Pipeline Pilot)
Zobacz też : Licencja i żetony
| Oprogramowanie naukowe |
Biovia | Discovery Studio ⋅ Materials Studio [ CASTEP ] |
|---|
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|