Virtualenv: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
 
(Nie pokazano 11 wersji utworzonych przez 3 użytkowników)
Linia 1: Linia 1:
−
'''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona.
+
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Virtualenv</small>
  
−
== Jak używać ==
+
'''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.
  
−
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł pythona
+
== Jak utworzyć i uruchomić środowisko wirtualne ==
 +
 
 +
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona w wymaganej wersji:
 +
 
 +
  qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 +
  module load Python/MOJA-WYMAGANA-WERSJA
 +
 
 +
Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/projekt):
 +
 
 +
  virtualenv $HOME/projekt
 +
 
 +
Uruchom utworzone środowisko wirtualne:
 +
 
 +
  source $HOME/projekt/bin/activate
 +
 
 +
== Jak wyłączyć środowisko wirtualne ==
 +
 
 +
Użyj polecenia
 +
 
 +
  deactivate
 +
 
 +
== Przykład instalacji pakietu w środowisku wirtualnym ==
 +
 
 +
Poniżej zaprezentowano procedurę instalacji pakietu cif2cell w środowisku wirtualnym Pythona.
 +
 
 +
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona
  
 
   qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 
   qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 
   module load python
 
   module load python
 +
 +
Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/cif2cell)
 +
 +
  virtualenv $HOME/cif2cell
 +
 +
Uruchom utworzone środowisko wirtualne
 +
 +
  source $HOME/cif2cell/bin/activate
 +
 +
Zainstaluj odpowiedni pakiet (w tym przypadku do instalacji cif2cell wymagany jest pakiet PyCIFRW)
 +
 +
  pip install PyCIFRW
 +
 +
Zainstaluj oprogramowanie cif2cell w katalogu $HOME/cif2cell.
 +
 +
W tym celu rozpakuj pobrane pliki oprogramowania cif2cell i przejdź do katalogu ze źródłami tego pakietu
 +
 +
  tar -xf cif2cell-1.2.10.tar.gz
 +
  cd cif2cell-1.2.10
 +
 +
oraz uruchom polecenie
 +
 +
  python setup.py install --prefix=$HOME/cif2cell
 +
 +
W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.
 +
 +
Aby użyć zainstalowane oprogramowanie cif2cell należy wykonać polecenie
 +
 +
  $HOME/cif2cell/bin/cif2cell
 +
 +
== Jak użyć oprogramowanie zainstalowane w środowisku wirtualnym - zadanie wsadowe ==
 +
 +
Oprogramowanie, które zostało zainstalowane w środowisku wirtualnym można uruchomić w zadaniu wsadowym.
 +
 +
W tym celu należy umieścić w skrypcie następujące polecenie
 +
 +
  $HOME/cif2cell/bin/cif2cell
 +
 +
 
 +
 +
== Virtualenv w sieci ==
 +
* [https://virtualenv.pypa.io/en/stable/ Dokumentacja]
 +
 +
 +
 +
'''Zobacz też:''' [[Oprogramowanie KDM]], [[Python]]
 +
{{oprogramowanie}}
 +
 +
[[Kategoria:Oprogramowanie]]
 +
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]

Aktualna wersja na dzień 14:05, 17 mar 2020

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Virtualenv

Virtualenv jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.

Jak utworzyć i uruchomić środowisko wirtualne

Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona w wymaganej wersji: 

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 module load Python/MOJA-WYMAGANA-WERSJA

Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/projekt): 

 virtualenv $HOME/projekt

Uruchom utworzone środowisko wirtualne: 

 source $HOME/projekt/bin/activate

Jak wyłączyć środowisko wirtualne

Użyj polecenia 

 deactivate

Przykład instalacji pakietu w środowisku wirtualnym

Poniżej zaprezentowano procedurę instalacji pakietu cif2cell w środowisku wirtualnym Pythona.

Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona 

 qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb
 module load python

Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/cif2cell) 

 virtualenv $HOME/cif2cell

Uruchom utworzone środowisko wirtualne 

 source $HOME/cif2cell/bin/activate

Zainstaluj odpowiedni pakiet (w tym przypadku do instalacji cif2cell wymagany jest pakiet PyCIFRW) 

 pip install PyCIFRW

Zainstaluj oprogramowanie cif2cell w katalogu $HOME/cif2cell.

W tym celu rozpakuj pobrane pliki oprogramowania cif2cell i przejdź do katalogu ze źródłami tego pakietu 

 tar -xf cif2cell-1.2.10.tar.gz
 cd cif2cell-1.2.10

oraz uruchom polecenie 

 python setup.py install --prefix=$HOME/cif2cell

W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.

Aby użyć zainstalowane oprogramowanie cif2cell należy wykonać polecenie 

 $HOME/cif2cell/bin/cif2cell

Jak użyć oprogramowanie zainstalowane w środowisku wirtualnym - zadanie wsadowe

Oprogramowanie, które zostało zainstalowane w środowisku wirtualnym można uruchomić w zadaniu wsadowym.

W tym celu należy umieścić w skrypcie następujące polecenie 

 $HOME/cif2cell/bin/cif2cell


Virtualenv w sieci


Zobacz też: Oprogramowanie KDM, Python

Oprogramowanie
naukowe 		Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD:  Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k


Źródło: „https://kdm.wcss.pl/w/index.php?title=Virtualenv&oldid=6077”