Gromada

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe

Z dniem 12 czerwca 2008 roku klaster Gromada został wycofany z użytku. Służył użytkownikom KDM przez 3,5 roku. Informacje zawarte w tym artykule dotyczą stanu serwera sprzed wycofania.

Gromada
Kontakt
gromada @ kdm.wcss.wroc.pl

Gromada - klaster składający się z węzła dostępowego HP rx2600 oraz 32 dwuprocesorowych węzłów obliczeniowych Intel Tiger2 (łącznie 64 CPU) spiętych siecią InfiniBand (Mellanox) o przepływności 10Gbps i siecią Gigabit Ethernet przy użyciu przełącznika 3Com SuperStack 3870. Klaster w całości znajduje się w szafach rack 19". Wszytkie komputery pracują pod kontrolą systemu operacyjnego Linux Rocks.

Zestawienie

klaster : moc obliczeniowa : węzły : procesory : L3 cache : pamięć : dysk /home : dysk /scratch : system operacyjny :

gromada.wcss.wroc.pl 368,8 GFlops dostępowy 2x Itanium2 1.3GHz 3MB 4 GB DDR/266 500 GB (SAN) - Linux Rocks

obliczeniowe (32) 2x Itanium2 1.4GHz 3MB 4 GB DDR/266 - 140 GB Linux Rocks

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, ADF, Autodock, CPMD, GAMESS, Gaussian, MOLCAS, MSC.Marc, MSC.Mentat

Kompilatory

GNU GCC, Intel

Biblioteki

LAM-MPI, MPICH, OpenMP, MKL, GotoBLAS, ...

System kolejkowania

OpenPBS

Uwagi

Katalogi robocze

Jeśli użytkownik będzie musiał "ręcznie" usunąć pliki z katalogu roboczego (/scratch), należy najpierw wykonać komendę:

> cluster-fork ls -l /scratch/$USER/

Wydrukowana zostanie zawartość katalogów roboczych użytkownika na wszystkich węzłach klastra. Należy znaleźć węzeł z szukanymi plikami (np. compute-1-13) a następnie zalogować się na ten węzeł:

> ssh compute-1-13

Następnie skasować poszukiwane pliki:

> rm -rfv /scratch/$USER/plik*

Zalecenia dla użytkowników

• Dane, dla których nie muszą być utrzymywane kopie zapasowe (backup ;), proszę trzymać na dysku /scratch na leo.

• Nie wolno uruchamiać obliczeń generujacych duże pliki wyników w katalogach domowych, ze względu na obciążanie systemu NFS. Proszę używać do tego celu dysków lokalnych /scratch.

Zobacz też: Maszyny obliczeniowe